當天晚上9點左右，正在並行行駛的日俄兩國艦隊，突然發生了變化，日本聯合艦隊的編隊，突然從2列變成了4列，而且全部開起了高速，不顧右舷的俄國艦隊編隊，直接右轉，向着俄國艦隊的尾部衝去。
俄國人被日本人的突然行動嚇的夠嗆，看到日本人全體高速衝向自己艦隊的尾部，以爲日本人要憑藉速度優勢，對俄國艦隊進行一口一口的蠶食。排在最左邊的6艘戰列艦立刻發起了戰鬥警報，也開始提到戰鬥速度，向左轉向，以阻攔日本艦隊攻擊自己艦隊的後部。
誰知道日本人根本就沒開炮，冒着俄國人的炮火，直接穿過了俄國艦隊的後部，徑直向日本九州島方向駛去。俄國艦隊一邊對着日本艦隊發射炮彈，一邊高速向海參崴方向撤退，看着日本人不管不顧的像逃命一樣，俄國人也摸不着頭腦。
俄國人不知道日本要幹啥，但是水面下的臺灣潛艇裡的各級指揮官都立刻反應了過來，日本人這是要逃跑啊。立刻，埋伏在四周的潛艇都得到了指揮艇的命令，自由攔截正在逃跑的日本和俄國艦隊，按照遠近距離，自由追擊，力爭全殲。
全殲命令是全殲命令，但是在這種情況下，連發布命令的潛艇指揮官高建功也知道，這次玩現了，在黑夜中，追逐幾十艘水面戰艦，並且要全殲，基本就是做夢，只要對方想跑，認準了方向，關閉燈火，只需跑出幾公里，潛艇就會找不到它的蹤跡了，雖然臺灣潛艇上都裝備了主動聲吶，但是在這麼混亂的戰場中，很難分辨是那條船，跑到哪裡去了，只能憑藉大概的方向，追擊那些低速的艦艇，至於像驅逐艦、雷擊艦、快速巡洋艦這類的船隻，潛艇就是開足馬力，也追不上。
一時間，本來很寧靜的海面上突然暴起了幾朵火焰，那是被魚雷擊中的日本和俄國艦船發出的火光。水面下的幾十艘臺灣潛艇，接到攻擊命令以後，在最短的時間內，都選定了早就選定好的目標，發出了攻擊。藉着火光的指引，海面上還沒有跑遠的日本和俄國戰列艦、後勤艦大多露出了蹤跡，並引來水下更猛烈的攻擊。
由於日本人提前佈置好了戰術，那就是不管誰受到攻擊，其他船隻必須高速返回日本沿海的港口，必須減速或者停船營救，也不用開炮攻擊可疑目標，只有一個字，逃！
所以日本的4只艦隊，在發現己方艦艇被攻擊以後，更是瘋狂的向前向前，毫不遲疑的逃命。而俄國艦隊則不知道潛艇這個殺神的存在，還以爲是遭到了日本艦隊的伏擊，馬上擺開了迎戰隊形，保護着後勤艦和受傷的軍艦先行撤退。不過俄國人沒用多久，就反應了過來，攻擊自己的不是日本人，因爲在遠處水面上，日本聯合艦隊的一艘戰列艦正在熊熊燃燒，照亮了大片的海域。
既然不是日本人，那是誰呢？從古至今，未知纔是人類最可怕的敵人。由於找不到攻擊目標，而自身又頻繁被攻擊，俄國艦隊在堅持了半個多小時以後，再也堅持不住了，剩餘的船隻紛紛開足馬力，向着各個方向逃竄。
兩方在水面上逃，一方在水下追，如果當時有衛星的話，從衛星照片上你會看到，幾十艘大小艦船像被海怪追一樣，無頭蒼蠅般的在海面上瘋跑，剛開始還能分辨出來日本和俄國艦隊的區別，到了後來，有些日本軍艦和俄國軍艦都跑到了一起，白天還在拼死搏殺的對手，到了晚上，居然肩並着肩，朝着一個方向行駛，而且是誰也不打誰。
這場你追我逃一直持續到了深夜，才因爲潛艇找不到目標，而停止了下來，本來高建功還想統計一下戰績，結果各艇報上來的戰績由於現場混亂而重複了不少，數據一拿上來，嚇了高建功一跳，按照這個數據，日本和俄國艦隊應該被全殲，而且至少沉了2次。。。
雖然戰果很輝煌，但是高建功心裡卻很忐忑，因爲這次行動的目的是儘量不暴露臺灣潛艇，但是由於各種因素，日本海軍顯然是發現了什麼，結果造成了這種混亂的局面，潛艇不得不提前發起進攻，按照正常的推算，肯定有不少小型快速艦艇突圍了出去，不管是俄國人的還是日本人的，這次臺灣潛艇是藏不住了。對於這個作戰結果，高建功不敢保證，回到臺灣以後，部長或者總統會不會追究自己的指揮責任。
雖然忐忑但是該做的還是要做，反正也暴露了，高建功電告了臺灣海軍參謀部，請示下一步指令，並建議，偷襲日本軍港，因爲按照各個潛艇提供上來的消息，俄國海軍艦艇逃走的不多，而且基本沒有逃向海參崴方向，而是向着朝鮮、中國大陸甚至臺灣方向跑的有幾條。而日本艦隊大多是向着自己的軍港逃竄的，所以如果能及時跟進，說不定能在軍港附近，再消滅一些日本艦船。
劉芾在臺灣接到高建功的戰況彙報，一點沒有感到意外或者失望。從剛開始的日本艦隊，到前兩年的八國聯軍海軍，臺灣潛艇部隊已經連續偷襲了4次，雖然都很成功，不過最後一次還是被八國聯軍裡面的有些船隻發現了端倪，要不是清政府急赤白臉的把責任大包大攬，說不定上次臺灣潛艇就露餡了。經過了這些年的發展，臺灣的經濟、工業和國防已經和那時候有了本質的區別，再加上歐洲列強本身也出現了很多問題，這幾年對亞洲的關注逐漸減弱，劉芾已經不是很怕暴露臺灣海軍的實力，就算現在英法美德四國聯合起亞洲的艦隊，也不見得就能把臺灣怎樣，大不了就是一拍兩散，把臺灣幾個港口打爛，然後各國在亞洲的港口也別想舒服。反過來說，現在這幾個國家別說聯合了，德國在歐洲跟英國已經快撕破臉了，法國和德國更是世仇，他們之間不打起來就是好事，不一定能爲了日本或者俄國來趟這趟渾水。
看到高建功後面的建議，劉芾覺得這個新任的第一潛艇大隊大隊長的眼光和魄力還是不錯的，比他的前任更具有侵略性。抱着破罐子破摔，有便宜不佔王八蛋的心裡，劉芾批准了這個建議，不過在命令中嚴謹潛艇部隊深入日本軍港，以免造成不必要的損失，更不能把沉沒和受傷的潛艇留在日本港外，就是沉，也要想辦法炸碎了再沉。
接到劉芾的新命令時，高建功已經帶領着完好無損的70多艘潛艇行駛到了日本平戶島北側，由於夜晚的混戰中，有幾艘潛艇被四處亂跑的軍艦撞傷了潛望鏡和船體，不能跟隨大部隊作戰，高建功已經分出了幾艘潛艇，護送着受傷的潛艇去匯合點匯合補給艦，以便返回臺灣修理。
在潛艇部隊來到佐世保軍港的西側入海口時，天色已經矇矇亮，凌晨的大霧正從水面上升起。對於佐世保這個港口，臺灣潛艇並不陌生，作爲把日本海軍當做第一假想敵的臺灣海軍，幾乎每個禮拜，都會有3艘潛艇在軍港外圍施行偵查巡邏，他們不僅會運送一些內務部的情報人員登上附近的島嶼，還會把軍港內的一舉一動，都詳細記錄，並帶回臺灣，交給內務部和海軍參謀部作爲戰略資料整理存檔。
由於當時潛艇作爲一種水下武器，還沒有在各國大面積裝備，所以也基本談不上反潛這個概念。佐世保軍港除了一些水面的水雷外，就是用巡邏船和武裝商船作爲預警設施，發現了敵人蹤跡，再利用有利的地形和岸炮進行打擊。但是對於潛艇這種從水下悄悄溜進來的作戰方式，基本上沒有任何防護和反制。
出於小心謹慎的原則，高建功只派了3個小隊，攻擊30艘潛艇分批潛入軍港內，剩下的潛艇按照方位，分別隱藏在西側出海口北邊、和南邊，作爲接應部隊。