其實，丁應泰如此對待朝鮮，除了爲了報復，也是爲了反駁朝鮮，讓他們幫不了楊鎬求情。
況且，丁應泰彈劾朝鮮的奏疏，除了彈劾朝鮮君臣，讓他們自顧不暇以外，其實也是在彈劾支持楊鎬的參加援朝之役的大明文武。
因爲丁應泰的奏疏說得明白，朝鮮與楊鎬結合，欺騙皇帝朝廷，這明顯戳中了當時在朝的萬曆帝的逆鱗。
畢竟，楊鎬因爲“再造之恩”，在朝鮮威望很重，手裡也有一批私交不淺的援朝精兵悍將，而且他又和次輔張位聯絡密切，種種方面，都讓楊鎬逐漸變成萬曆帝猜疑的對象了。
雖然萬曆帝並非嫉賢妒能的皇帝，但少年時期張居正和戚繼光的內外合作，卻是成了他的心病。
現在，張位在內，楊鎬在外，封疆大吏和宰輔的關係很近，這自然不是皇帝可以容忍的，首輔趙志皋正是看中這一點，纔會在重新主事時，讓他的門生丁應泰去朝鮮彈劾楊鎬的。
因此，有了丁應泰的彈劾，萬曆皇帝自然抓住機會，要把楊鎬和張位這一派的讓他心中不安的人撤職，以求安定了，哪怕是他知道楊鎬的能力，以及陣前換帥不妥。
好在，邢玠的能力也不俗，再加上明軍援朝的多爲精銳，再有豐臣秀吉於死於日本京都伏見城，日軍無心戀戰，這纔沒讓援朝之役出現大亂子。
不過，楊鎬撤職之事，也就此成了定論，即使有着朝鮮的陳情疏，以及不少參加援朝之役的文武求情，但萬曆皇帝完全按照丁應泰所奏，下旨處置楊鎬，並由此牽連張位等人，讓得被冷落的首輔趙志皋成功鬥倒了權勢一日千里的張位。
這一點，從朝鮮爲他們自己上疏三次，萬曆皇帝對明朝歷來重視的朝鮮小蕃的辨誣態度便可看出端倪。
彼時，因爲丁應泰奏疏所提三點，朝鮮不得不一一辯解。
“一則曰誘倭入犯；一則曰愚弄天朝；一則曰招倭復地；一則曰交通倭賊。或以爲結黨楊錦朋欺天子；或以爲剛憤求援，移禍天朝。”
首先針對丁應泰所謂“誘倭入犯”之罪，朝鮮疏文着重陳述朝鮮與日本交往之緣由及《海東紀略》一書的來歷。
指出正統年間，申叔舟前往日本，此事當時朝鮮即上報明廷，“至於《海東紀略》則乃是陪臣申救舟的倭人所記其國風俗世系地圖，遂因其本稿，附以小邦館待倭奴事例，作爲一冊，名爲《海東國記》。
“蓋小邦與日本，聲跡邈然，只是來則不拒，略爲羈糜之計而已。至申叔舟往來之後，稍知其國事蹟，因譽出一編以爲異國奇聞”，因此，所謂“誘倭入犯”，完全是無稽之談。
第二，對於丁應泰所謂是否尊正朔的問題，乃是學習《春秋》之做法
“蓋此書只因其國所記而添注，故其國偕稱年號之下，分注天朝年號，以標日本偕稱之某年爲天朝建元之幾年。如曰嘉吉元年即正統六年雲者是也。大書者本記也，分書者添注也。如一即字，其意尤明。《春秋》因魯史所作，故大書魯元年，其下分注周平王幾年，亦可因此而有疑於尊周之義乎”。
朝鮮以此，反駁丁應泰不能以《海東紀略》一書的年號表述方式指責朝鮮不尊正朔。
第三，對於所謂稱祖稱宗之事，朝鮮更稱丁應泰這是“無知妄作之罪’。
“自三國以來，禮義名號慕仿中朝，多有侔擬。至我先臣康獻王凡有干犯者，一切釐正，以至微細節目，亦未嘗不謹，以爲上下截然之分。傳
之子孫守如金石。而獨其稱號，則自新羅、高麗，有此謬誤。蓋以臣民襲舊承訛，猥加尊稱，相沿而不知改此實無知妄作之罪”。
因爲朝鮮國王稱祖稱宗，乃是圈新羅以來，所沿襲的做法，並不是朝鮮朝纔有的，所以這也是一個“無知妄作”之罪。
朝鮮辯誣使對丁應泰的彈劾奏疏針鋒相對，一一駁斥，並且對丁應泰之意圖，大加質疑因爲“督撫、按鎮，殆盡一網，東征將士之專意主戰者，皆被詆斥，且懼在事之幸完，務壞諸人之成績”，實乃大謬不然也。
對於丁應泰的駁斥，朝鮮分三次遣派辯誣使去明朝上疏，然而前兩次，都在萬曆皇帝和明廷討論事情是否屬實，而不見結果。
直到第三次，朝鮮終於獲得明廷兵部等九卿討論所謂朝鮮國王“誘倭入犯”之事，無人認同此說。
最後明廷才得出結論：“朝鮮世篤忠貞，無替德通倭之理，疏極悲惋有局高蹐厚之情。載賴我皇上堅彼百年不二之心，免行一時無端之勘。”
這意思便是明廷認同丁應泰所奏彈劾朝鮮一事，並不真實，明廷終於爲朝鮮國王昭雪，並且在日軍大敵當前、理應團結一心共同殺敵的形勢下，挽回了因爲丁應泰彈劾，雙方緊張的宗蒲關係。
只是，雖然朝鮮罪名得雪，然而此時楊鎬卻早已撤職，他背後的張位也被罷相，而楊鎬在朝鮮的親信將領，也被明廷下旨處罰。
這已經達到了萬曆皇帝打壓張位、楊鎬一派的目的。
當然，這並不是說萬曆皇帝不支持主戰派，他只是對掌握重兵的楊鎬和內閣權勢大的張位，私下之間聯繫深，並且相互包庇勾結，非常在意。
而這一點，從當時萬曆皇帝爲了覈查朝鮮事情，竟然派了有名的無恥之人徐觀瀾去核查朝鮮之事。
徐觀瀾，字道本，善寫楷書，作爲言官，在名聲上，以敢說真話著稱，然而事實卻不是如此，對他有利，他纔會講真話，無利便顛倒是非，就這樣，也混成了著名直臣。
而徐觀瀾去朝鮮查明事情真相，明顯是接受了一定授意的，其查勘東征事宜五請，然後便奏四路喪敗之狀，萬曆皇帝得了信，立馬下旨，“旨下部，斬馬呈文、郝三聘以徇，一元等各帶罪立功”。
並且，萬曆皇帝還讚賞丁應泰和徐觀瀾說：“御極二十六年，未見忠直如此人者。”
同時，萬曆皇帝還將丁應泰的名字寫在御用屏風上，以此告知明廷他對丁應泰的態度。
這些動作，自然極大的震懾了明廷中爲張位、楊鎬求情的人，讓他們不敢妄動，拖延了朝鮮雪冤求情之事，也讓萬曆皇帝能快馬斬亂麻的罷免張位，撤楊鎬之職，同時打擊楊鎬在軍中形成的山頭勢力，不至於撤了楊鎬的職，讓明軍在朝鮮出現內訌的亂子。