1945年8月10日，日本天皇接受了盟國的停戰公告，9月2日日本簽署無條件投降書，第二次世界大戰結束，可是新疆的戰事又步入了新的高氵朝。
此時，北疆的阿山地區局勢更加混亂，烏斯滿早在11月12日成立了阿山民族政府，以自己爲總理，隨後和達列力汗和蒙古人民共和國哈里哈拜爲首的的聯合暴動軍先後三次大規模進攻首府承化，炮彈不斷打進這座小城，但在中國軍隊艱苦卓絕的抵抗下，承化還在堅守中。
9月6日，聯合暴動軍主力趕到戰場，發動第四次攻勢，中國守將高伯玉看形勢不對，在阿山北部的哨所已經撤退，自己面臨着彈盡糧絕的危險，援兵是不用想的，在廣闊的新疆大漠中國軍只有不多的軍隊分散駐防，現在到處開戰，早已應接不暇。
所以只能靠自己了，於是率守軍和百姓3000餘人和剩餘的糧食棄城向北突圍，希望能看在都是反法西斯同盟的面子上暫時進入外蒙古避難，但人家不和你講友情，在奧爾朵提達阪遭到外蒙古軍隊阻擊。
9月9日，民族軍趕到，與蒙古軍前後夾擊，經過激戰，俘虜了高伯玉和一部分軍民，另有少數人員穿越戈壁攤突出包圍。
在伊犁，以蘇聯的託合托米什爲基地的聯合暴動軍在蘇聯軍事顧問的帶領下奪取了伊犁等地，成立了伊犁專區。科姿洛夫中將很快就制定了一個兵分三路，支取迪化的作戰計劃
。
南路進攻阿克蘇，6月26日聯合暴動軍先頭部隊4500人和參加暴動的牧民們一起向遇到的第一個據點鐵列買提達版發動進攻，很快這個堅守在這個的一個排就盡忠職守了。
中國軍隊新編騎兵2師4團就趕到了，他們在強大到可以捻死自己的對手面前勇敢拔出了自己的劍，發動反擊，戰鬥持續了很久。
8月14日聯合暴動軍攻克拜城，8月19日聯合暴動軍向第二道防線展開進攻，僞共和國內政部長阿巴索夫親自指揮部隊攻城，雙方反覆激戰8月26日，聯合暴動軍能夠直接面對阿克蘇城了。
這使得城裡迅速開始組織防禦，整修工事，四處搜尋糧食，現在重擔壓在城裡的新騎2師5團的肩膀上了，全城居民已經被要求全部參加自衛隊，枕戈待旦，等待着最後時刻的到來。
9月6日外圍戰鬥打響了，阿克蘇城的漢族人口很少，可以徵用的人員就更少了。全部力量加上手持木棍的自衛隊也不超過2000人，居民支持聯合暴動軍的卻是絕大多數。
9月8日聯合暴動軍對阿城展開了持續一天的炮擊，伴隨着炮聲，聯合暴動軍開始了猛烈的衝鋒。新騎2師5團團長趙漢奇不斷組織敢死隊把突入城裡的聯合暴動軍打出城去，雙方不斷的反覆爭奪一些據點。
戰鬥中趙團長開始抓拿親聯合軍的人，用鍘刀處以死刑，這就包括了小阿巴索夫，城外聯合軍指揮官阿巴索夫的親弟弟。
到了9月12日5團團長趙漢奇組織了一隻200多人的突擊隊，深夜潛出城外，夜襲聯合軍軍營，打聯合軍一個措手不及，聯合軍暫時後退。
9月23日，聯合軍再次攻城，聯合軍驟烈的炮火如雨而至，聯合軍在炮火掩護下如同波浪般，發起一波又一波的衝擊，衝在最前邊的敢死隊和國軍發生慘烈的白刃戰，互拼手榴彈。
5團副團長房慶安也被打成重傷。
一直到9月29日，聯合軍孤注一擲發起總攻，城外徹夜激戰，國軍將可以參加戰鬥的人員已經全部動員起來參加民團了，遠遠望去阿克蘇城如同一座爆發中的火山。天亮了，聯合軍退卻了。
10月，另一隻聯合軍攻擊了阿城附近的英吉沙和焉耆，但被中國軍隊擊退，還擊斃了蘇聯指揮官，繳獲高射炮，迫擊炮，步槍等武器
。
騎5團知道再打下去一定會應爲彈盡糧絕而失手的，所以10月6日凌晨，他親自帶隊對聯合軍發動反擊，聯合軍拼命阻擊，國軍勇猛衝鋒，很快就突破敵陣，用暴烈的近戰，使比他們多的多的聯合軍抵擋不住，向溫宿撤退。
1945年10月12日張治中將軍到達新疆，開始了和平談判。46年7月南部新疆的聯合軍退往蘇聯。
早在45年4月，更龐大的聯合暴動軍在炮兵、裝甲車和飛機的支援下開始向迪化進軍。
9月聯合軍開始進攻烏蘇，精河，這個通向迪化的要道。聯合軍動用了至少40多門大炮，用輕型坦克打前陣，以蘇聯空軍進行空中支援，猛攻中國軍隊陣地。
新45師支持不住，轉而突圍，很快聯合軍騎兵揹着馬槍，挎着手榴彈就追上了，幾個快速衝鋒，把新45師分割開，師長郭岐被俘，另有一個團突出重圍，退到了瑪納斯河。
同時在迪化的中國軍隊決心殺身成仁，作出了死守迪化的決定，第八戰區副司令長官兼參謀長郭寄鞽親自抵達迪化指揮，第46師師長徐汝誠擔任指揮官，防衛第一道防線瑪納斯河。
謝義鋒的新2軍部分部隊防禦第二道防線景化，馬呈祥整編騎兵第1師防守迪化中心。這些聯合暴動軍裝備精良擁有蘇聯援助的坦克，轟炸機，重炮等重型火力，那些三，四流國軍只有些淘汰貨。
但是如同在東線戰場一樣，蘇聯軍隊和蘇聯裝備，訓練，指揮的暴動軍，並沒有展現出什麼高超的戰鬥力來，和一幫子國軍末流部隊打的難分難解，在外無援兵，而彈藥沒有補充越打越少的情況下這些民團級別的國軍打的還不賴，直到一年後的1946年4月中蘇達成協議停戰，也沒有被攻克。
1946年4月，在停戰協議達成後，蘇聯莫斯科東方大學畢業的阿合買提江－哈斯木出任民族軍領袖，民族軍在和談後根據協議暴動軍主力原來的17個團，2個獨立騎兵師，5個步兵旅，被改編爲6個團。
民族軍總司令鮑裡諾夫將軍也回到蘇聯由伊斯哈克伯克接任，1946年整個夏天，民族軍突破了協議的限制，開始擴大編制，壯大實力。