正是因爲有了基礎，別人花費許多時間也不容易感覺到的真氣流轉，兩人毫不費力的就感覺到了。於是按照峨嵋心法，引導氣息在身軀上順着任督二脈作了一遍小週天運轉，雖然不是很暢通，但是也能完成。這一運轉，兩人才算是真正有了自己的真氣，開始了另一個不同的人生。
他們在洞中沒有其他事情分心，傷心之餘，他們彼此也不願意交談，沒事就作小週天運行，不過十幾天，已有小成，真氣運轉如意，周天暢通無阻。
肖韻馨又給兩人一本《大周天運行》，教兩人作大周天運行，把真氣運到四肢百脈上去。大周天比小週天難多了，因爲小週天的經脈仗着融合的氣勁，原本就是通的，所以僅僅十幾天就可以運轉如意，暢通無阻，大周天的許多經脈確是閉塞的，要用真氣去打通。
卓寧和回瀾開始練功後，都努力避免提起去留問題。
回瀾雖知道卓寧不可能回到塵世生活，但怕卓寧反感，一直不敢告訴卓寧。只盼着兩人能永遠在此練功，對大周天的運行能否成功並不放在心上。每天只是按照心法運轉，遇到阻礙更是不放在心上，更不求強行通過，似乎能在這裡永遠的練功也是人生一大享受。一遇阻礙，便引導真氣回去作小週天運行，增加真氣的儲藏量後，再次試探通過。
卓寧一直認爲肖韻馨不放他出去，不過是想要他留下來，雷神人圍山只是藉口。他想着自己不認真練功，肖韻馨看事不可爲，就會放自己出去。地洞中閒來無事，卓寧只不過靠練功打發時間，也可以安安回瀾的心，對大周天能否成功更是不放在心上。
如此一來，兩人練功都沒了求成之心，無焦無躁，心平氣和，正符合了修道境界，居然只花了兩個多月的時間就打通了大周天。這樣的速度，使肖韻馨驚喜交加，她當年可是花了二十多年時間纔打通大周天。兩人對修煉一無所知，倒是一點也不覺得自己的出衆。
紫雲靈芝還有幾天就會長成了，肖韻馨根本想不到兩人會在靈芝長成前練成大周天，這樣服食的效果自然更好。肖韻馨囑咐兩人繼續大周天的運行，務必使真氣暢通無阻。囑咐完後，留下食物，駕駛鑽地梭鑽進土裡。
峨眉山腰一株千年古樹，枝繁葉茂，生機盎然，根系發達，即便是在十多米的地下，根系也粗壯有如兒臂。
這裡早就被肖韻馨挖空，形成另一個地洞。這個地洞比回瀾他們練功的地洞小一些，只剛剛容得下鑽地梭。整個地洞成球形，中間凌空穿過古樹的粗壯樹根，樹根上生長着一株潔白細嫩的半圓形菌類，正是峨眉派精心培育上百年的紫雲靈芝。這個地洞中漆黑一片，不像練功的地洞，肖韻馨在洞壁上混合了一些熒光土，可以發出柔和的光芒。
肖韻馨離開練功洞穴，靈活的駕駛着鑽地梭停在地洞的下方。她對這裡非常熟悉，沒有一點光線也能準確的停好鑽地梭。紫雲靈芝這幾天就要成熟，現在正是關鍵時刻，她擔心紫雲靈芝，決定在此守候，直至紫雲靈芝成熟。，
肖韻馨坐在鑽地梭裡沒有出來，默唸了一個發光咒語，她立刻沐浴在柔和的光線裡。肖韻馨感到很滿意，這段時間，自己的功力果然恢復不少，好些不需要太多真氣的咒語又可以運用自如。修煉也真是主要在於修心，這道理以前雖然知道，但卻一直體會不了，倒是在見着回瀾和卓寧後，觸動前情，急時醒悟，豁然明瞭。
藉着微弱的光芒，肖韻馨站起來再一次仔細觀察紫雲靈芝。紫雲靈芝晶瑩潔白，細嫩光華，背面隱約透出一圈一圈的淡紫色雲彩的圖案，肖韻馨知道這是靈芝即將成熟的標誌。雲彩圖案會越來越明顯，當它完全顯現出來時，紫雲靈芝就長成了。紫雲靈芝本來是長在古樹的樹枝上，顏色是紅中透紫，外形乾澀枯槁，一點也不起眼，看上去活像是一片風乾的爛蘑菇掉在樹枝上，但肖韻馨把它移栽地底後，不知是否因爲沒有陽光，卻越長越是白皙無暇，越長越是潤滑鮮嫩，直到最近纔在背面隱約透出雲彩圖案。
肖韻馨看着紫雲靈芝，搖頭輕嘆一聲，紫雲靈芝帶給峨眉派的究竟是什麼？雷神人攻山之時，肖韻馨怕紫雲靈芝有閃失，顧不得對抗雷神人，立刻跑到樹枝上小心挖下紫雲靈芝。考慮了很久，才用鑽地梭在古樹的根系處挖了一個地洞，將靈芝移栽到樹根上。肖韻馨還怕靈芝不能成活，又守候多日，一直用真氣小心呵護。
等到她確定靈芝已經成活，鑽出地底尋找衆師姐時，峨嵋派已經只剩下徐韻瓊一人了。若非肖韻馨只顧呵護靈芝，憑着鑽地梭至少可以救回幾個師姐，雷神人是到不了地下來的，鑽進地底，大家就安全了。不過不知道師姐們會不會鑽進地底，她們平時一直笑肖韻馨像老鼠一樣，弄個鑽地梭出來在地底行動，她們自詡光明磊落，不屑於地底勾當。
大凡靈物惠草，都有異獸守護，但這株紫雲靈芝早由人力養護，此時成熟在即，肖韻馨只好親自守護了，肖韻馨坐鑽地梭裡，地洞中又恢復一片漆黑。
肖韻馨守護無事，默默運行真氣，不多時就已入靜，周圍一切盡在體察之中。這段時間，肖韻馨除了採集食物送給回瀾和卓寧外，所有的時間都在這裡靜坐練功。
這樣過了三天，紫雲靈芝背面已經可以清楚的看見紫色的雲彩圖案，再過一天，它就成熟了。這時紫雲靈芝開始冒出一股淡淡的雲煙，發出細不可聞的清香。隨着時間的過去，紫雲靈芝冒出的雲煙會越來越濃，香氣也越來越盛。
肖韻馨知道已經到了關鍵時刻，紫雲靈芝成熟在即，振奮起精神，更加仔細的體察周圍的動靜。這時一陣鑽土之聲傳入肖韻馨的耳內，接着一隻穿山甲鑽進地洞，顯然是窺視紫雲靈芝而來。肖韻馨知道，聞香而來的各種怪物會越來越多，自己的功力不過恢復少許，對付起來會越來越吃力。
她當機立斷，揮劍斬斷樹根，連樹根帶靈芝一起放進鑽地梭，也不不理會穿山甲，徑自駕着鑽地梭回到回瀾和卓寧正在練功的地洞。紫雲靈芝即將成熟，樹根上的養分足夠供應，沒必要再留在這裡了。
肖韻馨駕着鑽地梭回到練功地洞，停好鑽地梭，自己雖然離開了，卻把紫雲靈芝留在鑽地梭裡，又封住出口。這樣就把紫雲靈芝的香氣封在鑽地梭裡，可以大大減少怪物的到來。
肖韻馨等了一會兒，回瀾和卓寧作完一次大周天運轉，收功來到她面前。
肖韻馨舉手阻止兩人說話，自己快速的道：“紫雲靈芝即將成熟，我把它封在鑽地梭裡，希望可以最大限度的減少怪物的到來。一會兒等紫雲靈芝成熟後，你們兩人立即分食，然後馬上作小週天運轉。這次你們必須連續運轉九遍，即便聽見動靜，中間也不能停頓。”