當夜趙昺又召見了趙孟錦和劉洙、黃顯耀、劉志學三人。首先就江璆‘出走’一事徵求了他們的看法，他們以爲江璆雖無可能背叛帥府，但其擅自調軍有插手軍務的嫌疑和拉攏後軍的跡象。
因爲後軍皆是由朝廷撥給的義勇組成，當時爲了加強他們的戰鬥力，將大部殿前禁軍調入其部充任中、低級軍官，所以是帥府對其控制力最弱的一部。而江璆曾統軍多年，又曾帶領義勇在廣東與敵作戰，十分了解他們的需求和心理；加上殿前禁軍基本上都是江氏子弟兵組成，其會十分容易將後軍收爲己用。
趙昺知道軍隊是自己立足這個世界的根本，因此必須掌握在自己的手中，不論什麼原因都不能將軍權拱手讓人，而江璆此舉不論是否有插手軍務的企圖都觸及了他的逆鱗，是他不能容忍的。既然自己的幾位心腹愛將都由此看法，那就必須採取措施以防不測，絕不能讓江璆將後軍變爲江家軍，並將後軍重新置於自己的麾下。
原本趙昺是準備將中軍和前軍置於瓊州，作爲防禦海峽的主要力量；左、右軍分置昌化和萬安兩軍，作爲兩翼，隨時增援瓊州；而將戰鬥力最弱的後軍放在最南邊的吉陽軍，作爲維護島內穩定的主要力量，同時充當預備隊。如今這種情況下，他當下做出了調整，將後軍置於瓊州，放在自己的眼皮底下，而前軍則駐紮在吉陽軍。
而趙昺起先是想將從廣州帶來的各路義勇集中編入各軍，但現在也不得不做出微調。他計劃將摧鋒軍和勇敢軍編爲新軍，不足之數自各軍撥調，保留摧鋒軍軍號，由帥府直接管轄。九江降兵則盡數編入水軍。陳氏兄弟所領義軍編爲五個指揮分別撥入各軍，而江璆所招募的義軍則分散編入各軍補充原有的缺額。
對於整軍趙孟錦等人都表示同意。因爲帥府軍接連擴軍，原本的護軍已經成爲了少數，若再不整訓將有被其它各部吞併之虞。正可藉助整軍的機會，加強老班底的實力和影響力，從而增強統御力。而現在各軍居無定所，修築軍營和防禦設施是當務之急，整訓又勢在必行，成爲一個不可調和的矛盾。
趙孟錦提出先可將各軍教頭統一編爲一隊由都統司直隸負責教戰，然後再行抽調各級軍官入營輪番進行整訓，待教導完畢回營後再教授士兵，從而達到以一教十提高整體戰鬥力的目的。劉洙又提出可以區別不同兵種一一編隊，分別教戰，這樣既可以加快整訓速度，又能加強專業訓練，以保證訓練效果。
趙昺深以爲是，其他幾位也十分贊同。於是他命各人回去後立刻將想法寫成條陳，報送撫司，自己在從中周旋以儘快促成此事，如此一來江璆即便想反對他也鞭長莫及，而等他回來木已成舟想改變也無力達成。這樣就削弱了江家在帥府軍的影響力，而其想插手軍務也不能夠，卻進一步確定了趙昺統帥的地位。
趙孟錦等人清楚只有保證殿下在帥府的權威，他們才能在現今‘敵’強我弱的情形下站穩腳跟，保住自己的地位，利益的一致性讓他們對殿下的話當然言聽計從。而趙昺通過整軍不但加強了對各軍的控制力，且提高了帥府軍的戰鬥力，進而讓自己能在這亂世之中守住一方淨土，求得一條生路……
接下來兩天，趙昺又召見了莊世林和郝雲通、周翔等屬官，密會了應節嚴等人。而得知江璆率軍‘出走’之事已過去三天了，帥府派出尋找的人還沒有傳回消息。情況不明，衆官也對此事都保持沉默，也沒有人公開議論此事，使得事件彷彿成了禁忌一般。
但帥府軍上島後要處理的事情很多，不可能一直等下去，要儘快對幾件大事做出安排。於是在到瓊的第三日，趙昺聚將議事。參會者除帥府各司主官及案首外和軍中統制以上將領外，瓊州所轄州縣首官及屬官皆列席參會。首先由各司和瓊州主官講了當前形勢，介紹了情況，並提出需要解決的問題。
按照慣例下一步該由衆人商議，拿出意見，由殿下做出決斷。可殿下卻一反常規，而是對人事進行了安排，宣佈由撫帥應節嚴主持帥府工作，主管瓊州軍政事務；鑑於江璆擅自離島，轉運司由副使潘安主事，陳則翁爲轉運司判官協理工作，待江璆歸來查明情況後另行處置。同時免去趙與珞路管轉運使之職，瓊州知州不變，兼任軍前轉運使；提刑司和常平司兩位主官不變。
接着任命王府侍讀、帥府記室鄧光薦爲瓊州廉訪使，負責監察帥府及各州縣官員，同時督查軍紀，整肅不法；任命趙孟錦爲瓊州兵馬使，統管瓊州所屬各路兵馬，同時仍兼任本職；任命劉洙爲沿海防禦使，統管各路水軍，設置水寨禦敵；任命陳任翁爲摧鋒軍統制，負責整編摧鋒軍和勇敢軍。
原摧鋒軍統制馬發爲瓊州招討使，負責平定地方不法，清剿海賊；帥府都作院主事周翔兼任瓊州都作監寺監，負責一應軍械的修造及建造軍營、堡寨。其後命令各軍準備開拔，前往駐地，相應計劃由撫司和都統司商定。
而瓊州各州縣官員暫時各安其職，聽候調遣，待帥府考官後再做定奪，要求各州縣舉薦賢才以爲朝廷所用。同時給百姓解釋清楚，帥府軍來瓊是爲抗擊蒙古人的入侵，告知不必慌張。萬不可藉機巧立名目收取捐稅，騷擾百姓。再有各州縣要儘快整理好相應公文、賬冊，整理好倉廩，以備各有司查檢。
隨着殿下清朗的童音，堂上有人歡喜有人愁。應節嚴閉目細聽，殿下所言大部分是他們早已議定之事，且並無多少出入。但他還是從細微的變化中發現殿下還是對江璆出走之事產生了戒心，其中調整正是針對江璆和後軍做應急之策，可江璆這個禍首還不知在何地……