戶部尚書郭允厚的確是找到了左都御史商周祚和刑部左侍郎張雋寧，兩人也都答應郭允厚去向東廠交涉，要將順天府尹邱茂華轉移到刑部大牢。
但明顯東廠的行動速度更快，都察院和刑部還沒來得及行動，順天府尹邱茂華就供出了他這個戶部尚書和一個叫蘭鐸的商人。
再加上吳又可直接當着朱由校面提起御藥房的一批藥材下落不明之事使得御藥房少監鄒應權提前被東廠緝拿下詔獄，而李明允根本就沒來得及將順天府尹邱茂華被革職下詔獄的事告知給御藥房少監鄒應權。
因而也就使得這幾個企圖趁此霍亂爆發而發筆橫財的革新派官員的反應明顯慢於皇帝朱由校的爪牙，即便是李明睿沒有直接參與到這件事中來，甚至也並不是很知情，但在知道戶部尚書郭允厚被傳喚進宮的消息後，他也已經有一種山雨欲來風滿樓的感覺。
連戶部尚書郭允厚都被牽連了進來，自己這個內閣大學士只怕也逃脫不了干係，一時間，李明睿就不由得冷汗直冒。
朱由校看着丹壁下匍匐在地的戶部尚書郭允厚，冷聲問道：“說說吧，這是怎麼回事，那個叫蘭鐸的商人是誰，還有你是如何跟順天府尹邱茂華、御藥房少監鄒應權勾搭上的，朕可不希望用東廠的烙鐵逼你這個三朝老臣把真相說出來！”
郭允厚此時倒是淡定的很，能從魏宗賢時代過來的老臣，其心智早就是爐火純青，不用朱由校明說，他就已經猜到定是邱茂華或者御藥房的鄒公公已經出賣了自己，而且陛下已經把話挑明，自己若是再狡辯無疑是徒勞的，但他也能確定的是，現在陛下應該還沒有知道這件事和閣老李明睿有關係甚至還不知道這個叫蘭鐸的商人就是閣老李明睿之弟。
再一思及朝廷局勢，郭允厚很快就篤定了要犧牲自己保李明睿的想法，以達到讓革新派實力不至於因此而大損的地步，因而，便聽郭允厚說道：“陛下仁德，罪臣萬分愧疚，此事的確是罪臣昏聵貪酷所致，罪臣見此次疫情爆發，各類藥材價格暴漲，便想聯合御藥房少監鄒應權先讓順天府尹邱茂華昧下這批藥材轉移給一個叫蘭鐸的商人，然後再利用罪臣是戶部尚書之便動用官銀高價購回這筆藥材，以達到貪墨之銀！”
郭允厚的話剛一說完，朱由校直接將旁邊一玉如意直接丟了出去，重重地砸在這郭允厚身上：“你好大的膽子！朕給予你郭家的好處不少，緣何還如此貪得無厭！你豈止是年邁昏聵，簡直就是目無朝廷王法！”
郭允厚此時自然不敢說一句大話，他也不確定皇帝陛下朱由校在盛怒之下會對自己郭氏採取如何的懲罰手段，他現在只能儘量卑微的跪在地上，磕着頭：“是，罪臣有罪，請陛下賜臣死罪！”
“哼，朕要如何懲治你也由不得你，朕且問你，此是可還有其他人牽扯到裡面，你最好是如實招來，還有那個叫蘭鐸的人到底是什麼來路？”朱由校並不認爲此事就僅僅牽連一個戶部尚書郭允厚，因爲朱由校知道這郭允厚和李明睿關係匪淺，所以朱由校很難不認爲這李明睿跟這件事會毫無關係。
“罪臣不敢隱瞞陛下，此事就是罪臣和御藥房的鄒公公和順天府尹邱茂華所爲，那個叫蘭鐸的商人是罪臣認識的一藥材商，乃是山西五臺山人”，郭允厚還沒說完，朱由校就先站了起來，怒斥着郭允厚：“你已經在欺瞞朕了！你當真認爲朕是睜眼瞎，不知道你們這些人揹着朕再做什麼？你既然不說，那好，朕幫你說，那個叫蘭鐸的商人就是李明允，中極殿大學士李明睿之三弟，你說是也不是！”
郭允厚一聽朱由校這麼說，猛然地就擡頭看向了朱由校，他可沒想到陛下已經知道了這個，一時間他也知道該說什麼。
“朕且問你，此事和李明睿到底有沒有關係”，朱由校也知道這郭允厚此時也說不出什麼或者也不敢再說出什麼，便主動問起了他，他希望這郭允厚能夠明白，自己現在在乎的就只是李明睿有沒有牽扯到這裡面。
而郭允厚也知道陛下朱由校這樣問自己是想得到什麼，他可不敢也不想拉李明睿下水，便立即把頭搖得跟撥浪鼓似的：“沒有，絕對沒有，李閣老對此事毫不知情，這些都是罪臣幾個做下的事，真的跟李閣老毫無關係啊，陛下！”
朱由校不由得怒哼了一聲，冷冷笑道：“好啊，郭允厚，你還真是死豬不怕開水燙，都死到臨頭了還要爲李明睿背鍋，你難道真的不怕朕對你用刑嗎？”
郭允厚不由得哆嗦一下，剛搖頭準備說不怕，但一看見陛下朱由校那瘮人的眼神便立即又點了點頭：“罪臣怕，但罪臣更怕欺瞞陛下！”
朱由校聽從倒是笑了起來，雖說他刻意表現的很是憤怒，但對於郭允厚要死保李明睿的行爲他還是很願意看見的，因爲這樣的確可以使得革新派不至於實力大爲受損，畢竟一旦這郭允厚承認李明睿涉及到了這貪墨大案，自己就必須得罷掉這李明睿的職。
但該做的表面功夫還是要做的，至少不能守舊派的官員看出自己有所偏袒，也不能讓其他官員誤以爲自己這個帝王好糊弄，朱由校還是怒不可遏地吩咐道：“來人，將郭允厚帶入詔獄，重打四十大板！”
郭允厚明顯也猜到了自己這位陛下是想要什麼結果，所以爲了配合朱由校，他還是刻意做出一副很痛苦的樣子哭喊道：“陛下冤枉啊，李閣老真的沒有此案，皆是罪臣一人之過啊！”
雖然事實上，李明睿也的確沒有參與此事。
第二日，當李明睿等來到乾清宮西暖閣時，朱由校便將郭允厚、鄒應權、邱茂華、李明允等官員貪墨之案告知給了在場的諸位內閣成員，並言及戶部尚書郭允厚已經在詔獄畏罪自殺，邱茂華也同樣是畏罪自殺，而鄒應權則被梟首示衆，對於李明允也被判了斬立決，李明睿則負有對其弟監管不嚴之罪，被罰俸一年，革掉其太子太保之銜，連帶王承恩也被降爲御馬監太監。