妖族之所以撤退，原來是因爲巫族的祖巫按照原先制定好的計劃，在妖族大舉進攻不周山時便率領了幾百萬巫衆前去攻打天庭。妖皇帝俊和東皇太一在進攻前認爲僅靠鯤鵬一個人實力，妖族想要取勝自不在話下，自然是打着速戰速決的算盤，因此雖然探子那邊來報告巫族有大動向，卻也並不在意，只留下白澤、計招、英蒙等十大妖帥留守天庭！
可是讓他們萬萬沒有想到的是鯤鵬的修爲遠遠超出了他們的想象，雙方鬥了個兩敗俱傷。就在鯤鵬與妖皇帝俊及東皇太一僵持的那階時間裡，幾百萬巫兵巫將在九大祖巫（后土化身六道輪迴，而火神祝融水神共工則業已身隕）的帶領下直搗天庭。天庭重兵都在不周山，剩下的那些小嘍嘍如何抵擋得了，白澤，計招等十大妖帥乃是金仙境界，如何是準聖境界的九大祖巫的對手，瞬間就被殺得七靈八落。幸好此時妖族另一位準聖伏羲大神及時趕到，才勉強抵抗了一陣，但伏羲一人如何是九大祖巫的對手，只被打得口吐鮮血，好在伏羲有那先天靈寶伏羲琴護身，倒也護住了性命。妖族節節敗退，一直退到了天庭門口，天庭發生如此大的變動，卻驚動了妖后嫦羲。
妖后嫦羲與妖皇帝俊，東皇太一一般，都是在太陽星上化形，然自嫁與妖皇帝俊後便不再拋頭露面，只是每日在妖皇宮中教導自己所生下的那妖族十大金烏太子，故嫦羲雖也有準聖修爲，但卻不爲洪荒衆人所知。
嫦羲聽得宮外喧譁，暗道不好，只吩咐十金烏太子待在宮中，妖后出得宮來，卻是替下了遍體鱗傷的伏羲。衆祖巫生性暴戾，此刻更是殺紅了眼，哪管來人是誰？很快，嫦羲就抵擋不住，只被那奢比屍一拳砸在了心口，發出了那聲淒厲的叫聲。
妖皇帝俊與東皇太一趕到時，只見嫦羲躺在地上，心口一個大洞，血流不止，怕是活不成了，而十金烏太子只跪在嫦羲身邊也是泣不成聲，當下裡兩人也顧不得那些祖巫，飛身趕到嫦羲身旁。
嫦羲全靠一口元氣護住心神，爲得是要見那帝俊、太一一面，原來三人同在太陽星上化形，均爲那太陽真火本體，自小就青梅竹馬，那帝俊與太一卻是同時喜歡上了嫦羲，但一女安可嫁兩夫？故太一隻得忍痛割愛，帝俊與嫦羲亦常覺對太一不住。此刻，嫦羲將要身死，太一卻也顧不得許多了。
嫦羲只拉着帝俊與太一手道：“臣妾怕是不成了，還請兩位陛下早晚照看吾兒，勿使其惹是生非，否則必慘遭橫禍。”
嫦羲說完，擡眼看着旁邊的十金烏太子，眼淚便唰唰的流下，原來嫦羲自知將死，於是便以自己的生命爲代價推算十金烏的命運，不想竟然算出了十金烏太子日後有場大難，這讓她怎能不傷心痛苦？
嫦羲此話一出，再也壓制不住自身的傷勢，瞬間身體便化一團金色的火焰，向太陽星飛去，帝俊、太一及嫦羲都爲太陽真火之身，卻沒有想到嫦羲身隕後一絲真靈也沒有保住，只悲痛欲絕，兩人對望一眼，緩緩的的站了起來，憤怒地看着前面的九大祖巫。其實這一切都是因嫦羲以生命爲代價行那推算之法所造成的，如果她沒有受傷行此法頂多是身死元神入輪迴轉世，而偏偏她卻是在即將身隕之時發動如此秘法，燃燒了自己的靈魂，所以才身化飛灰一絲真靈也沒有保住。
九大祖巫饒是與妖皇帝俊、東皇太一交手過多次，此刻也被瞧得心裡發麻，事已至此，雙方自然要打過一場纔是。
就在兩邊都擺好架勢，近千萬巫妖之衆個個摩拳擦掌，大戰一觸即發之際。卻遠遠見天邊飛來兩個童子，只口裡叫道：“道祖有旨，命巫妖兩族罷戰！”接着又向天庭下方念道：“着妖師鯤鵬即刻到天庭聽宣！”
待鯤鵬趕到天庭，看到的自是劍拔弩張的巫妖兩族，以及妖皇帝俊與東皇太一那要吃人的眼光，原來妖皇帝俊與東皇太一深深地恨上了鯤鵬，如不是有他阻擋了衆妖，又怎麼導致了天庭受災，嫦羲喪命。鯤鵬見狀又如何能不明白他們二人的心思，也只是在心裡暗暗嘆氣，自己這次怕是和這兩妖皇的樑子結得大了，但妖族傷了幾千萬人族無辜的百姓，這一切也只是他們咎由自取，這又怨得了誰？當下也顧不得許多，走到兩童子前，拱手道：“貧道鯤鵬在此，不知道祖有何旨意？”
兩童子見人已到齊，便說道：“道祖有旨，爾等聽宣：巫妖兩族違反道祖命令，在規定的時間內大動干戈，妖皇帝俊與東皇太一殘殺幾千萬人族之衆，導致人族幾欲滅絕，罪無可恕，罰兩人閉關百年！九大祖巫偷襲天庭，打死妖后嫦羲，再次挑起洪荒大戰而導致生靈塗炭，命爾等自回祖巫殿思過，百年不得外出！此百年內，巫妖兩族不得再生事端，否則定不輕饒！”
雖然道祖有旨，但那帝俊太一與九大祖巫個個是桀驁不馴之人，眼下場面又是不死不休，心裡如何服氣？不過帝俊太一因剛與鯤鵬作過一場，傷還未好；而九大祖巫又因爲后土、祝融及共工不在，結不成‘十二都天神煞大陣’。兩方自是各有顧忌，都在想百年以後定要對方好看，當下道聲“領旨”，卻也不理會兩童子，各自去了。
兩童子無奈，只得繼續說道：“鯤鵬道人雖於不周山救助人族有大功，但侮辱聖人，妄論天地，卻是不該。故罰其思過百年，以償還此段因果，百年內且繼續守護人族發展，不得擅離人族居住地半步。”
鯤鵬一聽道祖要自己百年不得外出，也明白自己在不周山痛罵女媧娘娘與太上老君兩位聖人，那聖人都是些好面子之人，以後隨便逮着個機會肯定不會給自己好果子吃，道祖只罰自己思過百年償還因果，怕還是保護了自己。當下裡向虛空一拜，道：“鯤鵬在此謝過道祖！”
當下鯤鵬便回到了人族的居住地不周山，悟道見鯤鵬從天庭回來急忙前來見禮，悟道的樣與他閉關前卻是一點也沒變，依然是往昔的模樣。
鯤鵬詢問了人族發展事宜，人族經過這次不同山大劫難後，活下來的都是些青年強壯之輩，而後這百年時間將沒有了巫妖兩族騷擾，又有鯤鵬的守護，自然是要再次迅速發展。
鯤鵬安排好人族的一切事務後回到不周山洞府，又查看了悟道的修爲，悟道此時的修爲卻是比百年前提高了不少，已是金仙初期境界。鯤鵬見狀暗歎了一口氣，心道由金仙境界進入大羅金仙的境界卻不是時間的問題了，除了資質外，個人機緣也是必不可少的。悟道的性格決定了他以後的進境，恐怕要艱難許多。
百年時間裡鯤鵬見洪荒大地到處都是人族那不甘心入輪迴的鬼魂，這樣鯤鵬感觸頗深。這樣他不由地想起了後世中的‘往生咒’，於是他在不周山開壇設法，誦讀‘往生咒’超渡亡靈，頓時間那些不願意去地府輪迴的各族鬼魂，紛紛前往地府，根據其功德輪迴轉世，人族的鬼魂大多數都是一些善良之人，所以大部分都轉世爲人，人族即將迎來新一輪的人口高峰期，這也符合了人族大興的大勢。
天道有感鯤鵬的功績，再次降下了滿天的功德，這讓鯤鵬喜出望外，自己即賺取了大功德，又爲自己博得了好名聲。鯤鵬將這些功德收了起來，以備不時之需。而九天之外的諸聖，見到鯤鵬再次得到如此巨大的功德都感到天道無常。
卻說這百年時間一晃而過，那被道祖下令閉門思過的妖皇帝俊與東皇太一也脫困回到了妖皇宮，妖族上下自是一片歡呼。原來這百年來雖命令巫妖兩族不得挑起事端，但兩族幾千萬年打殺過來，豈是說停就停，大仗不打，小摩擦卻是在所難免。可經過不周山一戰後，妖族偷雞不成反折一把米，大本營妖皇宮都快被巫族攻陷，更慘的是妖后都被巫族斬殺，妖皇帝俊與東皇太一閉門思過下場，妖族自然成爲了老對頭巫族嘲弄的對象。而妖族其它大聖中，聖人女媧娘娘在媧皇宮內不問世事，伏羲需要養傷，妖師鯤鵬已經與天庭正式反臉，那十大金烏太子卻又成不了氣候，十大妖帥也不過只能對抗巫族幾位大巫而已。因此這百年來衆妖可謂是夾起尾巴做人，日子過得十分難受。如今妖皇帝俊與東皇太一回到天庭，妖族自然是復興有望。
妖皇帝俊與東皇太一兩人回到天庭，並沒有大張旗鼓，招兵買馬。而是繼續約束妖族一干大小不得擅起爭鬥，並將妖族大小事情盡皆託付與妖族大聖伏羲。而後兩人都對外宣稱要閉關修煉。只將一干妖衆弄得面面相噓。
原來妖皇帝俊與東皇太一兩人在閉關思過這百年時間裡，想起妖后嫦羲慘死的模樣，深恨巫族偷襲天庭，整日想着出去後要找巫族報仇。可巫妖兩族自盤古開天以來相鬥幾千萬年，卻是知根知底，誰也奈何不了誰，只怕兩人出去後還是如此僵持下去，兩人只鬱悶不已。
帝俊與太一終究是有大毅力之人，這百年來每日都夜觀天象，在如此恆心下，卻是弄清楚了天上三百六十五顆星辰的運行規律，當下兩人大喜，這時他們才完全弄明白了鯤鵬所佈置的‘周天星斗大陣’，帝俊用那先天靈寶‘河圖’、‘洛書’吸收天上星辰之力，用以鎮壓‘周天星斗大陣’的核心，從而做到完全掌控此陣的一切。
而巫族少了三大祖巫後，‘十二都天神煞大陣’已是很難在有所進展，有了完整的‘周天星斗大陣’他們已無需再怕巫族那‘十二都天神煞大陣’，再加東皇太一有先天至寶‘混沌鍾’在手在旁邊協助。只要打倒了巫族的九大祖巫，其餘的巫衆自然也就不足爲慮。