剩下的情節就是主角找到先前伏羲和女媧駕駛的諾亞號飛船，並找到盤踞在其中的被那個時代稱爲‘蚩尤’的礦石採集機器人，一翻激戰之後就在主角快要將鑲嵌在其頭部的梅馨本體女媧神石奪下來的時候，突然一個白色虛影出現，用強度極大的高壓電將其擊暈。
在白色虛影指揮蚩尤要將主角殺死的時候，一直在主角意識深處無法外出的辰雲這次卻因爲高強度的瞬間電流而脫離出主角體外，也就是類似‘離魂症’一類的情況。
脫離出主角體外的辰雲和伏羲保護下了暈迷中的主角，並且伏羲也認出了那個白色虛影是諾亞號內的智能系統的虛擬影像，名字就叫做‘諾亞’。
不管怎麼說伏羲也是諾亞的駕駛者之一，所以最後成功關閉了諾亞號的飛船動力，並且在辰雲的幫助下取下了鑲嵌在蚩尤頭上的青色女媧神石。
恢復過來的玄辰雨將姜夢藍接了過來，並且粗略的對玄囂訴說了一下控制女媧神石力量的辦法，而後兩人來到諾亞號內部，在伏羲的指導幫助下利用剩下的諾亞號機械組裝起一架雙人時間機器。
時間機器需要巨大的能源作爲動力，而本爲磁歐石的女媧神石就是最好的動力來源。但是軒轅和炎帝手裡的兩塊將要一代代傳下去，纔能有未來姜氏和玄氏二族的輝煌，自然是不能動的。正好有剛得到的主角母親梅馨的本體女媧神石，自然是不用白不用。
而梅馨的魂魄也被姜夢藍從吸魂符裡放出來，母子相見自然是一陣感嘆。終於在時間機器被伏羲確認理論上沒什麼問題後，姜夢藍和玄辰雨二人並沒有和軒轅他們告別，悄悄的離開了有熊氏，進入了時間機器。
但是就在時間機器啓動之後，突然出現故障，在緊急停止之後，兩人發現周圍的環境雖然還是大體那樣，但是已經變得和前段時間根本不一樣了，很顯然他們因爲時間機器的故障不知道停在啦哪個時間段裡。就在二人驚疑不定的時候，突然感覺不遠處有很熟悉的靈力波動，似乎有玄氏族人在那裡戰鬥一樣。
等二人趕往的時候，竟然看到兩個不可能出現的人，正是已經被玄奕派人殺死的安倍英明和安倍香織。
而他們兩人也看到了和安倍英明兄妹戰鬥的三個人，正是受了重傷的玄辰雨，玄辰賢，和玄辰武。這時玄辰雨和姜夢藍二人才反應過來——他們回到了自己那個時代，但是時間上出現了一點偏差，竟然是先前玄辰雨他第一次在玄辰賢二人帶領下去王石村被安倍英明襲擊的那個時間。
而在這時玄辰雨也突然明白過來，當初救自己的是誰了。不知道大家還記不記得第二卷的時候有一章‘神秘青年’那五個人正是時間機器出現故障而突然出現的玄辰雨，姜夢藍，伏羲，辰雲和梅馨的魂魄。
也就是說，玄辰雨當時其實是未來的自己救了自己，所以他才誤以爲是姜夢藍帶人救了他，而感覺很熟悉的樣子。當時明白過來的玄辰雨恨不得立即殺了安倍英明兄妹，但是怕出現蝴蝶效應纔沒動手，但是狠狠教訓他們兄妹一下倒不會介意。而且他自然也不會把自己的身份告訴先前的自己，當然，恐怕他說了先前的自己也不信。還是不要自己嚇唬自己的好。
在伏羲將時間機器調試好之後，幾人再次上路。但是就在快到他們定好的姜夢藍和玄辰雨去冥府之界之後三天的時間之後，時間機器再一次出現意外。梅馨爲了保護幾人將魂魄融入其本體女媧神石內，將全部能量釋放出來，保護了時間機器順利的停下里。但是融合了梅馨魂魄的女媧神石卻被捲入時空亂流，墜落在二十年前的王石村後山祖祠堂外，也就是玄奕和玄雲尚發現她的時間。
總是玄辰雨和姜夢藍順利的回到了屬於自己的時間，但是梅馨卻沒能回來，不得不說是個遺憾。而剩下的故事也就算差不多完結了。
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其實寫到這裡，原先計劃的還有幾卷，本來設計的是主角的時間機器出現意外，最後沒回到屬於自己的時間，而是來到了他所在的時間的兩百年後。發現世界已經完全變樣，因爲能源危機而爆發的第三次世界大戰在短短几個小時內毀掉了五分之三的世界，剩下的人類也因爲外面壞境的惡化而不得不捲縮在有保護罩保護的新城內，抵禦大氣中的灰塵和外面無數新生的變異生物。
而這時主角也明白了他們時間機器錯亂的原因，因爲這個時代的一個博士，從已經乾涸了的黃河支流上挖掘出了伏羲曾駕駛的諾亞號飛船殘骸，而發現了裡面一份電子文檔。經過破解後，就是時間機器的理論製造方法。
這個可以去看下第一卷，應該是十一二章這裡，曾寫過伏羲手裡拿着一份電子寫字板從飛船裡跑出來，高呼着他成功了的，就是那個寫字板。而那個博士也想製造一個巨大的時間機器，用來從歷史中運送資源或者將這個時代的人類轉移到歷史中去，來躲避已經惡化了的環境。
也就是在試驗的過程裡，與時空軌道內的玄辰雨駕駛的時間機器共鳴，而引發錯亂，將其帶入了這個時空。
等明白了發生的一切之後，玄辰雨和姜夢藍無奈之下只好繼續尋找回去的辦法。最後暗中借用伏羲的知識，幫助博士成功製造了一個時間機器，但是利慾薰心的博士想要殺死兩人滅口，自己獨佔時間機器。
最後博士的計劃當然失敗，而玄辰雨和姜夢藍在博士臨死前下達的自爆指令達成以前順利的從時間機器回到了自己的時代。
往後的還有幾卷是寫主角和姜夢藍去消失的瑪雅文明和埃及金字塔的，但是因爲這本書的成績，已經決定完結了，自然沒繼續寫下去的必要。
因爲新人第一次寫的原因，這本書太多太多的硬傷，改人稱，沒升級系統等等。不知道有多少人能堅持看完，也着實難爲大家了。謝謝大家，謝謝。
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整理一下各個時間的年份表
公元前20000年左右，亞特蘭蒂斯最後一任國王決定開拓月球殖民地，而排出被後世中國人稱爲‘伏羲’‘女媧’的兩名宇航員去選址調查。而伏羲是本名亞當的機械師，女媧是本名夏娃的生物學家。
同年，在伏羲女媧返航的前一天，作爲亞特蘭蒂斯主要能源的磁歐石發生有史以來最激烈的一次能量波動。
同年，磁歐石爆炸。作爲負責磁歐石能源管理的能量管理員海倫，被磁歐石碎片透體而死，靈魂與其融合，誕生了玄辰雨的媽媽，梅馨。
同年，伏羲和女媧駕駛的飛船被後世稱爲紅色女媧神石，也就是辰雲本體的一塊磁歐石擊中，而墜毀在後世亞洲地區。
同年，位於百慕大地區的海底實驗室也遭到了毀滅性打擊。衆人分崩離析後只有作爲其中央電腦程序員的波塞冬倖存下來，但是卻發現自己因爲實驗室內的生化藥物，而造成身體變異。
隨後幾年，波塞冬在其身體完全變異之後設計出一個人工智能，取名：扎爾西斯。
在扎爾西斯被波塞冬設計出後十幾年，想得到真實人類身體的扎爾西斯殺死了波塞冬，而被算計到這一步的波塞冬暗中留下的後門程序讓其製造出自己的一個克隆程序：莫費里奧。
公元前一萬年乃至更前，從諾亞號飛船的休眠系統裡醒來的伏羲女媧兄妹，發現世界已經完全變樣，而兩人也選擇了截然不同的兩條道路。
隨後幾年，伏羲想製造世界機器回到磁歐石爆炸前夕，結果失敗身亡。其靈魂被其作爲能源的一塊藍色磁歐石吸收，而誕生了日後的風尊。
同年，女媧利用諾亞號飛船內的生物培養系統，成功讓一批大爆炸倖存下來的類人猿擁有了初步的智力。
數年之後，一塊小行星般的隕石因爲被磁歐石爆炸而改變了磁場的地球吸引，就要撞擊地球。被女媧用所能找到的剩下的五塊最大的磁歐石碎片作爲能源的機器炸燬，但是負荷過大的機器爆炸，女媧犧牲。
剩下的五塊磁歐石碎片因爲爆炸分崩離析，就是後世所說的女媧神石。
公元前四千五百年，諾亞號飛船內的礦石採集器因爲磁歐石影響而產生智力，受到諾亞號飛船內主程序的影響，變成一個殺戮機器：蚩尤。
同年，被蚩尤殺戮的苦不堪言的軒轅和炎帝舉行祭祀，而被他們手裡的磁歐石影響，從冥府之界回到現世的玄辰雨和姜夢藍穿越時空來到這個時代。
同年，消滅掉蚩尤的玄辰雨和姜夢藍乘坐伏羲製造的時間機器離開，回到屬於自己的時代。
1965年，還是青年的玄雲尚和葉秋（玄辰雨的爺爺奶奶）發現了一塊白色女媧神石。
1967年，葉秋誕下一子，就是體內有白色女媧神石的玄奕
1987年，玄雲尚和玄奕在王石村後山祖祠堂發現了昏迷的梅馨。
1988年，姜林在崑崙山遇到狐香和狐玉。
1990年，主角玄辰雨誕生。
1991年，玄奕和梅馨爲了救治先天陽虧之體和沒有心臟的玄辰雨，而盜取了王石村內供奉的紅色女媧神石，並將其融入玄辰雨胸口內心臟部位。
同年，帶人追上他們的玄雲尚被風尊控制的玄辰雨大伯玄鴻暗算身亡，風尊現身。
同年，爲了保護玄奕和玄辰雨，梅馨意圖與風尊同歸於盡，但是失敗魂魄破碎。一片魂魄和海倫與斬邪內附着的夭夭魂魄融合成新個體。
同年，回到王石村的葉秋和玄奕，發現風尊控制玄鴻屍體，冒充玄鴻而將兩人通緝。無奈之下二人只好開始不斷躲避王石村的追捕。
1996年，五歲的姜夢藍和母親狐玉在後山被惡鬼襲擊，狐玉身死。姜夢藍也留下了寒毒的病根。
2008年，主角被風尊派遣的靈卒找到，而知道了自己的不同尋常。
同年，在四聖使幫助下，玄奕奪回了屬於自己的族長之位。
同年，在醫院內玄辰雨在快被林佳兒魂魄掐死的時候第一次邂逅姜夢藍。
同年，玄辰雨，玄辰賢，玄辰武三人碰到尋找女媧神石碎片的安倍英明和安倍香織兄妹以及認識了持有一塊女媧神石碎片的御鬼師東方軒。
同年，玄辰雨與姜夢藍定親
同年，玄辰雨被安倍英明和安倍香織抓往日本，並且目睹了百鬼之王酒吞童子的復生。
同年，玄辰雨認識了草雛神社的啞巴巫女千雪，和可愛的小琉璃，以及大宮司。
同年，酒吞童子被陰陽師首領安倍直輝殺死，並且向暗算玄辰雨。
同年，復仇而來的東方軒和追殺玄辰雨的陰陽師同歸於盡，玄辰雨被千雪所救，隨後喜歡上她。
同年，玄奕帶人前來，殺死了安倍家族的陰陽師
同年，玄辰雨和姜夢藍被百慕大海底實驗室的扎爾西斯和莫費里奧所俘獲。
同年，兩人帶着姜夢藍的克隆體紫柔逃出了百慕大海底實驗室。
同年，姜夢藍和紫柔被科學教頭目控制，要挾玄辰雨爲其帶出一個‘潘多拉盒子’
同年，玄辰雨發現那個科學教頭目其實早就是個死人，而被風尊控制。最後在歐洲驅魔人聯盟幫助下消滅了釋放出的屍洞和風尊。
同年，玄奕復活梅馨失敗
同年，玄辰雨和姜夢藍千萬崑崙山，尋找能去冥府之界的翳影枝，以便能夠找到梅馨魂魄。隨後在崑崙山認識了姜夢藍的姨媽狐香以及其女兒狐青青。
同年，得到翳影枝的兩人去冥府之界從東界王手裡救出了梅馨魂魄，而在回去的時候時空錯亂，進入了五千年前炎黃大戰蚩尤的時間。