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武則天最後以劉禕之與裴居道有私交，並暗地裡準備替裴居道平反，又與許敬宗的妾室有私情等諸多罪名，下詔將他賜死。結果劉禕之被殺，家產抄沒，幾位兒子俱被流放，妻女沒入掖庭!
劉禕之在獄中時，曾經上疏自陳，爲自己作無罪辯護，其所寫辯護書詞理懇至，見者無不傷痛。秘書郎郭翰、太子文學周思鈞共稱歎其文，併爲之辯護，結果同樣惹惱了武則天，貶郭翰爲巫州司法，周思鈞爲播州司倉。
劉禕之是武則天親手提拔的官員，是最早一批北門學士，這些年一直爲武則天搖旗吶威，武則天也對他給予了重用，並最終讓他位列政事堂，可以說是武則天的心腹大臣之一。誰也沒想到，這樣一位重臣，竟然會因爲私下與人交談時候幾句不合時宜的話就被賜死，連賀蘭敏之都沒料到過。
劉禕之在朝中任職多年，與許多大臣交好，他犯事後，許多人跟着遭殃，流放的流放，貶官的貶官，更倒黴的跟着丟性命，一些原本沒什麼罪名的人，只要和劉禕之有交集的，也被羅列了罪名。武則天重用的周興、來俊臣、丘神勣等人開始真正顯示酷吏的本性，大多的案件都交由他們審查，朝的一些大臣，逐漸被他們迫害。賀蘭敏之雖然不情願看到這樣的情況出現，但他也知道。這是武則天當上皇帝后必須要採取的手段，最好不要去阻止，而且他也需要武則天替他做這些。
那些與他政見不合，或者一直對他不滿的人，他也樂見借他人之人除去，但他倚爲親信的人，他是決不允許周興等人給他們加以罪名的。一些耿直之人，品格高尚者，他也會施以援手。在不惹惱武則天的前提下，減輕他們的罪名。
其實朝堂上的情況與武則天當皇帝前並沒什麼太多的改變，以前也有清洗。現在的程度雖然比武則天當皇帝前有點重了，但還不至於亂了朝綱。武則天很勤政，每天都親自批閱奏摺，當然賀蘭敏之也批閱很多，他把主要的精力都投入到處理朝事上。
安西和安北境內有亂，朝廷除了派使者招撫外，已經下令組建大軍，準備討伐。不知何因，武則天極力要求以程務挺和黑齒常之兩將各領兩部人馬，賀蘭敏之在考慮一番後也同意了。
最後的任命以程務挺爲安北道行軍大總管兼安北安撫大使。黑齒常之任安西安撫大使兼安西道行軍大總管，各率軍五萬，與兩都護府駐軍一道，出征平叛。
程務挺原任左羽林軍大將軍職，他出徵後。此職空了下來，武則天在問詢賀蘭敏之由何人暫時接替程務挺此職時，賀蘭敏之毫不猶豫地推薦了薛訥，最終武則天不情願地同意了，以薛訥爲檢校左羽林軍大將軍，代程務挺統領最精銳的禁軍——
這個夏天武則天沒出去避暑。是在上陽宮度過的。
夏天很熱，不過因爲大多的人都有很多事要忙，時間過的很快，轉眼盛夏就過去了，時節已經入秋，只是今年天氣有點怪異，到了八月中後，天氣還挺熱，讓人感覺非常不舒服。
程務挺和黑齒常之率軍已經進入安北和安西，這些年大唐軍隊的戰鬥力提升的非常快，而且一些“現代化”的武器也陸續研究出來，更不要說領軍的程務挺和黑齒常之都是非常出色的名將，對付戰力並沒有提升的突厥叛軍，形勢是一邊倒的，可以說叛軍一觸即潰，捷報接二連三地傳來。
看到大軍剛與你交手，報捷就頻傳，武則天心神大悅，馬上下旨嘉獎。看到自己提拔的兩位效仿不辱使命，輕鬆獲勝，賀蘭敏之也鬆了口氣，他也向武則天建議，在兩部人馬幾戰獲勝後，再派人招撫，爭取儘快平息北方及西北的戰事，讓邊關不再生亂，武則天也同意了賀蘭敏之的請求。
最早派出的招撫使者沒有勸動那些叛亂的突厥頭領，武則天非常生氣，下令盡數殲滅叛軍，但賀蘭敏之還是建議招撫並舉，以減少因戰亂帶來的破壞，他不擔心戰事擴大化，因爲他收到來自前方的秘報說明，叛亂的部落數量並不多，這些人並不是真的想匡扶大唐，只是想趁機作亂而已，大多的部落還是採取觀望態度，我大唐在安西和安北駐軍數量又不少，突厥部落如何敢大規模作亂。
這次平叛，賀蘭敏之原本提議是作戰任務主要交由各都護府麾下的兵馬負責，但武則天還是傾向再組大軍討伐，一些其他大臣也是如此建議，最後賀蘭敏之也同意了，但在戰事開始後，他覺得派兩位大將率軍出征，還是小題大做了，沒這個必要，可能集兩都護府的兵力，也能平息戰事了。
他也在懷疑武則天一定要讓程務挺和黑齒常之領軍出征的另外目的，雖然這兩將是最適合領軍出征的人員，但他總覺得武則天如此做，有更深層次的目的。這段時間賀蘭敏之與武則天之間相處雖然還是與如往那樣，但他總覺得，當上皇帝的武則天，心思改變的不小了，至於具體有哪些，他暫時講不出來。最主要的表現就是，武則天時常做出一些出乎他意外的舉動，事前也沒和他商量，這是挺讓他苦惱的地方。只是他與武則天面前對交談時候，卻沒這種感覺，他這位當了皇帝的姨母，又幾乎會全部同意他的要求，與以往沒有任何區別，他只能每天都過去請見武則天，什麼事都和她面對面商量，而不是用奏本或者其他形式，他相信，只要他天天面見武則天，武則天待他的態度不會有根本性的改變的，即使她努力想擺脫他的影響也做不到!
當然他爲了上官婉兒也要每天都進宮，隨着小姑娘的慢慢長大，進一步的發育，越加出落的婷婷玉立，清純可人，要是有一天見不着，還真的挺想念的!——
在入秋後，賀蘭敏之也爲鄭凌瑤和上官婉兒母女做成了一件她們最期望做到的事，經他手下人的細查暗訪，被武則天殺害的洛陽的上官儀及上官庭芝的墓地終於被確認。
上官儀和上官庭芝被殺後，不允許家人收葬，最後是被胡亂安葬的，將他們埋葬的都不知道是什麼人，沒有墓碑留下，也沒有其他明顯的標記，賀蘭敏之的手下是費了近一年的時間，纔將他們的墓地打探到的。在確認查找到上官儀和上官庭芝的墓地後，賀蘭敏之也特意帶鄭凌瑤和上官婉兒去拜謁祭奠了一番。
因這段時間上官婉兒在武則天面前表現不錯，才情也有展露，武則天對她真正的另眼相看起來，一些詔令也交由她起草，武則天登基時向天下發布的詔令，就是由上官婉兒起草的，武則天只是最終潤筆而已。那是一篇讓人稱道的詔文，賀蘭敏之看了也是稱讚不已。因爲上官婉兒表現如此出色，武則天每天都讓小姑娘侍在身邊，這次賀蘭敏之帶她出宮，可是費了一番心思才得以成行的。
上官儀和上官庭芝是被胡亂埋在邙山腳下一片亂墳崗中的，賀蘭敏之的手下發現墳墓後，尊鄭凌瑤和上官婉兒之意，將他們的遺骨擇另外安葬，修築了新墳，只是沒立明顯的墓碑。武則天沒答應給上官儀平反，賀蘭敏之不敢明目張膽地爲上官儀做這些事，只能待過段時間再說。
賀蘭敏之帶鄭凌瑤和上官婉兒來拜會是在新墳修築完成後，面對自己夫君和公公的墳墓，鄭凌瑤是悲痛欲絕，哭的死去活來。她除爲了親人們慘遭的不幸而哭泣外，也有爲自己這些年以來沒守婦道，沒盡孝道，卻和另外男人偷情，做出了不倫之事而羞愧。以前在與賀蘭敏之相處的時候，因爲諸多的考慮，及沒有接觸任何與上官儀和上官庭芝的東西，悲痛的感覺及負罪感並不強烈，並隨着時間的推移，這兩種感覺都慢慢淡去了，甚至她想着從了賀蘭敏之而終。但在面對上官儀和上官庭芝的墳墓時，鄭凌瑤壓在心底十幾年的悲意及負罪感馬上涌了上來，而且隨着哭泣越來越強烈，甚至都有了一死謝罪的念頭，只是看到在一邊哀哀哭泣的上官婉兒後，纔打住以死謝罪的念頭。
上官婉兒和心思和母親不同，上官儀和上官庭芝被殺時候，她剛在襁褓中，什麼事都不知情，與他們沒有一點親情的交融，只是聽多了母親所說家族的不幸後，她才清楚具體的情況，但這些年她一直得賀蘭敏之的照顧，賀蘭敏之在她心目中的地位沒人可以比，對死去祖父及父親的感情並不濃烈，心中的悲意遠沒有鄭凌瑤那麼強烈，最後是被鄭凌瑤感染起來，大哭了幾場。
賀蘭敏之好不容易勸住鄭凌瑤和上官婉兒，看看時間不早了，提議她們先回城，待以後再來拜祭，但鄭凌瑤的一番話卻讓他目瞪口呆!
“殿下，你使人替妾身在這裡修一座屋子，我要在這裡爲婉兒死去的祖父、父親守靈三年!這三年，妾身一直住在這裡，過粗茶淡飯的日子，爲他們守靈!”