戰鬥就這麼結束了，之後便是收尾的部分了。事實上很快的就有軍方的部隊衝進了神盾局的總部。空天航母的事情總統已經知道了，而尼克弗瑞的行動當然也和他說明了，總統這邊當然也有準備。
之前空天航母開始升空的時候，總統已經讓軍隊這邊開始行動了，之前是因爲擔心對方發現所以沒動，但是現在明顯尼克弗瑞秘密行動失敗，所以他們必須馬上行動，於是總統下令軍方開始攻擊，務必攔下三艘空天航母。
不過軍方這邊也沒來得及，這三艘航母自己就炸了。之後很快的軍隊也是衝進了神盾局的總部，控制了剩下的那些特工和部隊，不管是不是九頭蛇的人，反正都先抓起來再說。
其實現在還在地面上的特工基本上都不是九頭蛇的人了，空天航母上的那些才基本上都是九頭蛇的人，皮爾斯必須保證空天航母在自己的控制中，所以不可能放不是自己的人上去，不然內部出現問題怎麼辦，所以航母上的人都是九頭蛇的成員，當然現在他們也伴隨着航母的爆炸全部都死亡了，而地面的人雖然也有不少九頭蛇的人，但是剩下的大部分都是不知道怎麼回事的神盾局特工。
對他們來說皮爾斯是他們的局長，他們聽從局長的命令辦事，也不知道目前到底是怎麼回事，軍隊的人這麼就來了。不過軍隊這邊帶着總統的命令，他們能怎麼辦，也只能投降了。
局面很快就被控制住了，不管是皮爾斯還是交叉骨全部都被逮捕了，幾個想要錘死掙扎的九頭蛇士兵也被當場擊斃，當然也有準備繼續潛伏混在神盾局被抓的人裡面的，不過到時候也都會被一一審問。
洞察計劃的事情到這邊本來就已經告於段落了，然而很快的，頭痛的人就變成了總統這邊。是的讓他們沒想到的是，這邊的娜塔莎居然在軍隊到達之前，把神盾局的很多內部資料發送到了網絡上，以至於一部分政府機密的資料被公開了，當然大部分都是神盾局的內部資料。
作爲一個特務機關，他們做過的不能公開的事情可不少，這部分資料總統當然也不希望公開，不然只會引起民衆的猜疑和不信任，這件事可不是尼克弗瑞之前和他們說好的。總統也很意外，因爲尼克弗瑞和娜塔莎公開的資料對他們自己也非常的不利，他都想不通爲什麼兩人要這麼做。
然而對此，娜塔莎的解釋就是，神盾局不應該繼續存在下去了，這是隊長的命令。
當然這也是之前制定計劃的時候幾人討論過的事情，簡單的說就是破而後立，現在的神盾局已經被九頭蛇完全滲透殆盡，就算這次殲滅了大量的九頭蛇成員，但是誰又能保證重建之後會不會被再次滲透，很明顯這個組織是否要繼續存在也成了疑問，隊長的意見就是，讓神盾局成爲歷史吧。
尼克弗瑞一開始也是不同意的，畢竟神盾局也算是他的心血，然而最後他還是被說服了。所以他們也沒和總統彙報這件事，直接公開了資料，等於說直接毀了神盾局。
總統確實有些生氣，但是木已成舟，現在也沒什麼辦法了。本來他準備通過這次的事情，直接回收神盾局過大的權利，準備成立一個通過政府監管的新神盾局的，但是現在已經不可能了。那神盾局就成了最好的背鍋對象，大部分的責任都能直接甩到神盾局的頭上，然後直接宣佈神盾局解散，所有人員就地免職，接受調查。
當然不管政府方面是怎麼想的，林頓他們很明顯是不準備配合的，事實上面對目前的情況，政府這邊也有些不知道怎麼辦。這個世界已經發生了變化，他們明顯要面對更多類似的威脅，來自特殊人羣，甚至外太空的入侵，他們確實需要一直應對的小隊，復仇者計劃再次被提上了國會。
然而這個組織怎麼運作，算是什麼類型的組織，政府要不要參與，這些都成了國會爭論的焦點。國會再次吵的天翻地覆，不過這並不關林頓他們什麼事，此時林頓也是剛剛從醫院回來，再次回到了託尼家裡。
林頓去醫院也是爲了探望下隊長而已，之前林頓也是讓隊長自己解決和巴基的問題，把兩人傳送到了地面上。兩人則是繼續展開了戰鬥，然而結果卻是巴基這邊獲得了勝利。隊長的戰鬥能力雖然很強，但是面對巴基實在是處處留情，施展不開，被對方擊敗，然而巴基這邊居然最後也沒有下殺手，而是放過了隊長，之後便離開了，目前還沒被抓到。
隊長這邊身受重傷，不過他的恢復能力很強，身上的子彈被取出之後基本上也沒什麼問題了，估計幾天就能出院。
尼克弗瑞準備隱退，娜塔莎這邊身份完全公開，準備去搞個新的身份，彼得這邊自然是趕回去上課了，所有人各自分開，林頓自然也只能回到託尼這邊了。
好消息是託尼這邊關於絕境病毒的研究進展還算是成功的，只花了四天的時間，託尼已經研究出了最初的疫苗，目前已經給幾隻小白鼠做了實驗，先讓他們注射絕境病毒，然後再注射疫苗，目前爲止幾隻小白鼠的反應還算是比較良好，至於人體方面的實驗，他們沒有可以用的別的實驗對象，只能直接在波茨的身上進行了。而託尼也等不下去了，這幾天波茨的反應也不怎麼好，身體一直處於高溫狀態，好像隨時可能爆炸一般。
稍微有些擔心的，託尼對波茨進行了疫苗的注射，雖然他非常的擔心，但是事情好像也在朝着好的方向發展，通過後續的觀察，她體內的病毒正在減少，按照目前的速度，大概幾天內能恢復正常。
託尼這邊也是鬆了口氣，經過這次，他也是對生活有了一些新的感悟。
“所以你決定參與這個復仇者聯盟的項目？”林頓問道。
“我們需要一些力量來保護我們生存的地方，不是嗎？”託尼說道，“你不打算參加？我也是已經把你算進去了。”
“我這邊打算再去閉個關。”林頓說道。
“又是閉關？”託尼摸摸頭，“你該不會有直接消失幾個月吧。”
“不。”林頓說道，“這次可能是幾年也說不定。”
“……”託尼看了看林頓，“認真的？”
“大概吧。”林頓攤手，“反正我也不是給你找了個幫忙的人了嗎？”
“那個中學生？他真的是個中學生唉。”託尼說道。
“但確實也很有用嘛。”林頓攤手道。
“所以你這次是來道別的？”託尼問道。
“保重。”林頓說道。
“你也是。”託尼點點頭說道。
本來林頓已經準備離開了，不過想了想還是有件事沒完成，那就是宇宙立方。是的這東西還在自己的手上，按照之前和古一的約定，林頓不準備帶着這東西回去，畢竟之後自己還要來這邊呢，想了想，這麻煩的東西還是直接交給古一自己處理算了。
於是林頓這邊再次來到了紐約聖殿，剛進門，林頓就看到門口站着的古一，很明顯就是在等自己。
“你要回去了？”古一說道，雖然有些疑問的感覺，但是語氣倒是很肯定。
“按照約定，這東西交給你。”林頓也是直接拿出宇宙立方說道。
“兩塊無限寶石放在同一個地方不太合適。”古一說道。
“那你想個辦法交給別人吧。”林頓說道，“我這邊沒啥時間去找人了。”
“還是由你帶去放在阿斯加德人那邊吧。”古一突然說道。
“還是交給阿斯基德人保管？阿斯加德都炸了唉。”林頓說道。
“……”古一看着林頓沒說話，這不都是你乾的好事嘛。
“好吧好吧。”林頓攤手說道，反正也就是傳送一下的事情。
白光一閃，林頓再次出現在了宇宙船中，讓林頓有些驚訝的是，這次的宇宙船好像和上次自己來的時候不一樣。是的上次的宇宙船是一艘非常小的船，大概也就是小型飛機的大小，裡面的阿斯加德人都擠在一起，然而這次，他來到的宇宙船居然是一艘挺大的船。
索爾自然就在旁邊，看到林頓也是愣了下，不過馬上反應過來，起身說道：“你來做什麼？”
現在他對林頓當然依舊是敵對的態度，只是武器還沒到手，目前也不想和林頓起衝突，不然按照他以前的脾氣，直接就發動攻擊了。經歷大劫之後，他稍微的變得穩重了一點。
“別慌，我只是帶個東西給你而已。”林頓說道，“啥時候換的船？”
索爾也沒回答船的問題，而是直接說道：“帶個東西？是什麼？”
“這……”林頓剛想要拿出宇宙魔方來，結果旁邊門一開，海姆達爾直接走了進來，看到林頓也是愣了下，不過馬上說道：“有情況了。”