太昊鏡上，人類的後手已經使了出來。六百艘長大三十公里的大型運輸艦正在太陽軌道上加速，六百億星際遠征的人口在這些運輸艦上。當然不可能是每人三室一廳的居住空間，所有的人躺在維生倉內部，由維生倉系統給身軀提供休眠的能量，同時大腦神經元連接量子網絡保持精神上的活躍，在虛擬空間中和別人交往學習。同時每艘船上的人可以用思維控制軟材料和法力駕馭飛船。
只要虛擬空間模擬的世界夠龐大，在虛擬空間的人足夠多，那麼這場長大十餘年的太空旅行也不會悶。中醫各種穴道在二十一世紀未知的醫療效果，是因爲這裡和身軀中量子意識循環聯繫非常深，人體這麼複雜的系統，自然不能單純的用冷凍來處理人體休眠的問題。短時間速凍身體沒有問題。人體中量子循環不受物質身軀的驟然冰凍影響，依然會忠實的實行量子循環，但是量子能量循環這種神話中的魂魄是和身軀有着非常緊密的聯繫，量子能量循環需要的能量不足一個細胞的化學能量反應功率，但是終究是需要能源的。所以身體只能休眠，並且時刻從休眠中喚醒一段時間，保障量子循環的供能和身軀的聯繫，這是人體量子實驗室最中肯的研究成果。
這纔有了每艘移民戰艦必備的龐大虛擬空間，龐大能容納上億人在線的極度模擬真實的世界。
知道原劇情的程攀瞭解到第三部曲的敵人會從半人馬座來。所以半人馬天空方向一切星體都不作文明種子的考慮。六百艘飛船分三個移民目標，一個就是天狼星，但是移民計劃中首先不是找上天狼星，而是直接在它的伴星一顆白矮星上建造代森球。這顆白矮星上的物質一立方厘米三十公斤。大部分物質已經不是化學物質，但是還是有九牛一毛是化學物質，要知道這顆白矮星的質量可是和太陽相同九牛一毛夠了，但是在其表面絕對可以找到海量的重元素，作爲材料。利用引力波可以抽取部分物質。籠罩這顆伴星。移民會在二十年的時間內到達，當然如果計劃不足失敗，飛船也有回來的能量。這顆恆星星際距離是8.7光年
還有兩顆目標恆星就是伍爾夫359星與天苑四，這兩貨一個是比木星大個幾倍的紅矮星，一個是質量只有太陽百分之85的年輕恆星，距離一個是7.7光年，一個是十光年。但是都有在21世紀就發現的行星，能在21世紀能被發現，那個行星的質量就不用擔心了。可以製造代森球。人類現在加載基石系統的身軀可沒有那麼脆弱，不需要水只要能找到氧元素和碳元素就能生存，只要找到硅元素以及各種金屬元素就能控制太陽。
我們的征途是星辰大海，認知文明不能放棄自己的太陽，大部分人選擇留下了背水一戰，但是同樣將希望灑向星空，龐大的艦隊羣從太陽南北極出發，逐漸向着觸手可及的星空進發，在壯麗的星空下，原本龐大的遠征艦隊變得渺小，從色覺上逐漸變紅（紅移）。
艦隊的飛行也引起了九大行星的元靈注意，由於是朝着太陽南北極天區飛行。根本不會路過在和地球同一平面上的七大行星，隨着遠征艦隊逐漸加速到三分之一光速的亞光速。攔截也是不可能的事情。三階只是靈活但是不代表絕對速度就夠快，就像一個人可以揍到一個迎面而來騎自行車的人，這個只要以比自行車靈巧的速度閃避側過身子，一拳就行了。但是想追上五百米外不朝着自己過來一心想逃跑的自行車那是根本不可能的。
八大元靈仔細的觀察了一下遠征艦隊的彈道，當然不是有什麼壞心思，而是牢牢的記住，這幾個星球遠征的艦隊目標地點。元靈們已經承認自己這次看走眼了。不想如果有機會再次逃跑的情況下繼續犯這個錯誤，和人類這個種族死磕。
太陽曆26年，就在星際遠征艦隊逐漸駛出太陽系朝着宇宙深空形式的時候。進化三部曲的第二部曲劇情正式進入原劇情的高潮，人類聯盟再次將人類推到了可以和公元前一樣繁榮的時代，但是再次面臨審判的日子也越來越近。如同靈氣在地球上首次出現，是百獸的狂歡。紫霧和大火山爆發大地震的到來則是硅機生命進化的狂歡，進化三部曲核心都是在進化上。都是在自然選擇在上。
但是自然如何選擇，也比不上思維。烈日城中一艘總重四百六十萬噸百分之九十爲軍用軟材料，蘊含七十噸法力的戰艦朝着地球駛過來，這艘戰艦中是一位新晉級的學者二階——胡陽陵。這艘戰艦帶着是代表認知文明在地球展現文明意志的武器。
在地球上，端木和諸多一階同時得到消息，掌控者胡陽陵和人定勝天號戰艦即將到來，人定勝天號正在和炎黃城北極大廳進行量子訊號連接。
北美大地上。種種極限表明即將超級火山即將爆發，黃石公園逐漸隆起，大地上經常裂成一道口子，噴出熾熱無比的地下泉水，像高壓鍋的噴射的氣體一樣形成白色的氣體柱子衝到幾十米高的地帶。大量的異獸已經感覺到了大地深處的恐怖如同逃難一樣遠遠離開，大量的花草同一時間盛開，隨後由剎那芳華一樣枯死。
紫霧開採區內，諸多人類聯盟的技術人員看着畢竟紅色警戒的指標。紛紛離開了紫霧開採鑽井，隨着雲蓮明這個聖者的一聲令下，人類聯盟的成員開始大規模撤離美洲大地。北美洲即將是大能交戰的戰場，弱者自覺離開。
隨着人類聯盟的離開，北方炎黃城的力量開始南下，準備迎接即將到來的挑戰。美洲大地上那一股赤紅終於爆發了。黃石公園上百公里的土地上瞬間裂開，大地的力量乾脆撕開了那一層綠色植被的僞裝，沖天的紅色物質隨着黑煙飛上天空。這一刻地球表面似乎一個血泡裂開。紅色的超級岩漿拖着黑煙，朝着四面八方砸去。
如此壯觀的自然景象，所有大思維者以淡定的姿態觀看。端木向着王衝問道：“指揮官，地球上其他目標區域（這裡省略若干字，光學語言可以將所有火山地震帶完全表述出來。）怎麼樣”王衝傳輸了衆多超級火山的地震帶的詳細數據，並對每一個數據進行分析。說道：“我們的大地網格計劃起到作用了，地幔無法在地殼蓄積太多的能量同時大量的岩漿熱量被我們轉移。這些活火山地帶現在只是冒煙，雖然有所噴發決不可能到達超級火山的級別。只有黃石公園這塊，在新紀元還沒有到來的時候就蓄積了太多的能量。”
超級火山爆發後是大量的紫霧靈氣從大地深處涌出，擴散在到地球表面。一塊塊熔岩的巨大數百噸的熔岩石塊從天空中飛行數十公里，砸落在地上，赤紅的石頭碎裂後，裡面大量赤紅的硅機生物灑落在大地上。伴隨這種形式，硅機生命大規模登錄地表。
這時候破曉化身出現在衆多大思維者面前，王衝行了一個軍禮說道：“檢察者，我方檢測尚未發現大量一階威脅目標。”破曉化身擺了擺手說道：“所有一階謹慎出手，兩個二階在熔岩下等着，對面出多少一階，我們就以不超過兩倍的一階對戰。等待28天后支援戰艦到達。看誰審判誰。”
破曉說完，立刻離開並且飛行到噴發地帶上方五十公里處。當破曉離開後端木好奇對王衝問道：“支援戰艦到底是什麼裝備。”王衝搖了搖頭說道：“我也不知道。不過烈日城這次派過來一個掌控者看護武器看來是準備以雷霆之力，震懾地球上一切勢力。”
隨後王衝命令道：“無人#機軍團準備。給這些大地深處的朋友一個熱情的接待。告訴他們地表的我們給他們比大地深處更加溫暖的關懷。”
所有一階聞聲而笑，法力核心構架包裹人體的球形操作光幕，在遠處待命的戰機羣動了。離子束武器從天空中射過來。上百萬度高溫粒子束的確給予了從熔岩中走出的硅機生命前所唯有的溫暖。
赤紅帶着幾百度高溫的硅機生命在粒子火焰中大量的肢體被打得汽化，天空中黑雲不斷擴散，但是大量的金烏號戰機衝進了這片散佈天地之威力的地帶，用着如同傾盆大雨一眼的光柱，掃蕩一切可以可以動彈的熔岩生物。離子束光輝掃過是是大片的赤紅。
在地表遭到的火力太強。大量的硅機生命選擇了鑽地製造掩體和天空中集羣對射。飛旋的陶瓷子彈和離子光束你來我往的交錯，甚至碰撞。天空時刻都有機械墜毀。地面上粒子束開啓了一團團刺眼的白色火團
和激烈交火戰場不同的是王衝這裡諸多學者手上的法力快速閃爍，引動了光幕快速變化。北方大地深處一個個自動化工廠在軟材料的操控下立刻開始重新組裝。金屬零件在軟材料的加熱捏動下快速變形，快速組裝，削切金屬燒結陶瓷裝甲，流水化複合材料。組裝，這是機械的力量，超級大生產的力量，隨着學者思維的跳動整條生產線隨心變化，按照戰場的需要生產最適合的武備。而這種思維變化的速度遠不是自然選擇的進化可以比擬的。
雙手造世界，遠比等着自然改造自己更有效更快。
半個小時後第一批上百個潔白色長五百米的胖肚子運輸戰艦噴射藍色推進火焰快速朝着戰場趕來。隨着火山的一次跳動的噴發，大量的火焰石塊砸向運輸艦，運輸艦上的藍色水薄膜抖動着，石塊滑向一邊，上百噸的石塊只引起了運輸艦輕輕顫動。
到達戰場後，在天上的勁風中，運輸艦外部裝甲諸多零件快速變形變成了一個個炮管一樣的噴口。隨後大量的一米直徑雨滴狀白色的存在，從噴口中大量噴出，如同灑水樣衆多大型雨點拋灑至戰區，隨後在這些白色的雨點狀陶瓷球距離大地只剩一百米的時候，快速變形，在天空中瀟灑的變成了多足機械人。瀟灑的在地上滾了幾圈。然後降落。
第一批降落的機械人，忠實遵守傘兵天生就是被包圍的守則，在天空火力的掩護下，固守據點，挖掘地下掩體。隨着一艘艘拋射機器人的母艦越來越多，以及靠近戰場前線機械化部隊建造，大規模各種各樣制式不同機械人，在學者們的思維閃動下，周身法力跳動輸入的數據下，變成了專攻的利器。兵種不再單一，似乎沒有整齊劃一的美感。但是各種不同的兵種總是對着敵方不足的地方衝過去。有專門遠程打擊的，有挖隧道的，有快速衝鋒近戰的，有高速輕裝甲衝上去自爆的。在火山的持續爆發下，硅機生命越來越多的情況下，大工業生產的機械海反而在逼近火山口。頻繁的核爆在火山口周圍爆炸開來，讓沖天而上火山灰勢頭一停止。
爆炸這東西不全是破壞，更是可以對着一個方向釋放壓力，火山口正上方的核爆就將火山灰沖天的方向改變了。大量的火山灰被強大的核爆推到的地表，不再瀰漫在平流層中。
衆多學者通過量子指令，控制地球上龐大的生產體系，在無數齒輪旋轉，粒子切割器飛舞，衆多機械手組裝下。海量的材料變成學者心目中的工具。人是要用工具來加工一切自然物。這就是受到思維控制，廣義上的雙手，現在這雙手的力量足夠強，如此強大的火山爆發也只是可以改造的存在。
滔天的自然力釋放，但是人類雙手正在用力的按下去。
破曉看着腳下的超級核爆將火山爆發向着大地壓去，慢慢的說道：“快出來啊？”