陰陽是宇宙間的一般規律，是一切事物的綱紀，萬物變化的起源，生長毀滅的根本，有很大道理在乎其中。凡醫治疾病，必須求得病情變化的根本，而道理也不外乎陰陽二字。
拿自然界變化來比喻，清陽之氣聚於上，而成爲天，濁陰之氣積於下，而成爲地。陰是比較靜止的，陽是比較躁動的；陽主生成，陰主成長；陽主肅殺，陰主收藏。陽能化生力量，陰能構成形體。
寒到極點會生熱，熱到極點會生寒；寒氣能產生濁陰，熱氣能產生清陽；清陽之氣居下而不升，就會發生泄瀉之病。濁陰之氣居上而不降，就會發生脹滿之病。這就是陰陽的正常和反常變化，因此疾病也就有逆證和順證的分別。
所以大自然的清陽之氣上升爲天，濁陰之氣下降爲地。地氣蒸發上升爲雲，天氣凝聚下降爲雨；雨是地氣上升之雲轉變而成的，雲是由天氣蒸發水氣而成的。人體的變化也是這樣，清陽之氣出於上竅，濁陰之氣出於下竅；清陽發泄於腠理，濁陰內注於五髒；清陽充實與四肢，濁陰內走於六腑。
水分爲陰陽，則水屬陰，火屬陽。人體的功能屬陽，飲食物屬陰。飲食物可以滋養形體，而形體的生成又須賴氣化的功能，功能是由精所產生的，就是精可以化生功能。而精又是由氣化而產生的，所以形體的滋養全靠飲食物，飲食物經過生化作用而產生精，再經過氣化作用滋養形體。如果飲食不節，反能損傷形體，機能活動太過，亦可以使經氣耗傷，精可以產生功能，但功能也可以因爲飲食不節而受損傷。
味屬於陰，所以趨向下竅，氣屬於陽，所以趨向上竅。味厚的屬純陰，味薄的屬於陰中之陽；氣厚的屬純陽，氣薄的屬於陽中之陰。味厚的有泄下的作用，味薄的有疏通的作用；氣薄的能向外發泄，氣厚的能助陽生熱。陽氣太過，能使元氣衰弱，陽氣正常，能使元氣旺盛，因爲過度亢奮的陽氣，會損害元氣，而元氣卻依賴正常的陽氣，所以過度抗盛的陽氣，能耗散元氣，正常的陽氣，能增強元氣。凡氣味辛甘而有發散功用的，屬於陽，氣味酸苦而有通泄功用的，屬於陰。人體的陰陽是相對平衡的，如果陰氣發生偏生，則陽氣受損而爲病陽氣發生了偏生，則陰氣耗損而爲病。陽氣發生了偏生，則陰氣耗損而爲病。陽偏生則表現爲熱性病症，陰偏生則表現爲寒性病症。寒到極點，會表現熱象。寒能傷形體，熱能傷氣分；氣分受傷，可以產生疼痛形體受傷，形體可以發生腫脹。所以先痛而後腫的，是氣分先傷而後及於形體；先腫而後痛的，是形體先病後及於氣分。風邪太過，則能發生痙攣動搖；熱邪太過，則能發生紅腫；燥氣太過，則能發生乾枯；寒氣太過，則能發生浮腫；溼氣太過，則能發生濡瀉。
大自然的變化，有春、夏、秋、冬四時的交替，有木、火、土、金、水五行的變化，因此，產生了寒、暑、燥、溼、風的氣候，它影響了自然界的萬物，形成了生、長、化、收藏的規律。人有肝、心、脾、肺、腎五臟，五臟之氣化生五志，產生了喜、怒、悲、憂、恐五種不同的情志活動。喜怒等情志變化，可以傷氣，寒暑外侵，可以傷形。
突然大怒，會損傷陰氣，突然大喜，會損傷陽氣。氣逆上行，充滿經脈，則神氣浮越，離去形體了。所以喜怒不加以節制，寒暑不善於調適，生命就不能牢固。陰極可以轉化爲陽，陽極可以轉化爲陰。所以冬季受了寒氣的傷害，春天就容易發生溫病；春天受了風氣的傷害夏季就容易發生飧泄；夏季受了暑氣的傷害，秋天就容易發生瘧疾；秋季受了溼氣的傷害，冬天就容易發生咳嗽。
上古時代的聖人，講求人體的形態，分辨內在的臟腑，瞭解經脈的分佈，交會、貫通有六合，各依其經之許循行路線；氣穴之處，各有名稱；肌肉空隙以及關節，各有其起點；分屬部位的或逆或順，各有條理；與天之四時陰陽，都有經緯紀綱；外面的環境與人體內部相關聯，都有表有裡。
東方應春，陽生而日暖風和，草木生髮，木氣能生酸味，酸味能滋養肝氣，肝氣又能滋養於筋，筋膜柔和則又能生養於心，肝氣關聯於目。它在自然界是深遠微妙而無窮的，在人能夠知道自然界變化的道理，在地爲生化萬物。大地有生化，所以能產生一切生物；人能知道自然界變化的道理，就能產生一切智慧；宇宙間的深遠微妙，是變化莫測的。變化在天空中爲風氣，在地面上爲木氣，在人體爲筋，在五臟爲肝，在五色爲蒼，在五音爲角，在五聲爲呼，在病變的表現爲握，在七竅爲目，在五味爲酸，在情志的變動爲怒。怒氣能傷肝，悲能夠抑制怒；風氣能傷筋，燥能夠抑制風；過食酸味能傷筋，辛味能抑制酸味。
南方應夏，陽氣盛而生熱，熱甚則生火，火氣能產生苦味，苦味能滋長心氣，心氣能化生血氣，血氣充足，則又能生脾，心氣關聯於舌。它的變化在天爲熱氣，在地爲火氣，在人體爲血脈，在五臟爲心，在五色爲赤，在五音爲徽，在五聲爲笑，在病變的表現爲憂，在竅爲舌，在五味爲苦，在情志的變動爲喜。喜能傷心，以恐懼抑制喜；熱能傷氣，以寒氣抑制熱；苦能傷氣，鹹味能抑制苦味。中央應長夏，長夏生溼，溼與土氣相應，土氣能產生甘味，甘味能滋養脾氣，脾氣能滋養肌肉，肌肉豐滿，則又能養肺，脾氣關聯於口。它的變化在天爲溼氣，在地爲土氣，在人體爲肌肉，在五臟爲脾，在五色爲黃，在五音爲宮，在五聲爲歌，在病變的表現爲噦，在竅爲口，在五味爲甘，在情志的變動爲思。思慮傷脾，以怒氣抑制思慮；溼氣能傷肌肉，以風氣抑制溼氣，甘味能傷肌肉，酸味能抑制甘味。