事實上，塞外的蒙古帝國隨着北元的覆滅，早已經走到了終點，當初太祖皇帝定鼎中原，將北元一脈驅逐出關外，代表着黃金家族榮耀的孛兒只斤氏便失去了在韃靼當中至高無上的地位。
而最先起來反對孛兒只斤氏家族統治的是乞兒吉斯部的首領貴力赤，他否定了孛兒只斤氏統治的正統性，並且在建文元年殺死了北元的最後一位皇帝額勒伯克，自號爲汗！
但是可惜的是，貴力赤雖然終結了北元，但是他的汗位卻沒有得到其他部落的認可，反而被羣起而攻，在貴力赤殺死額勒伯克的第二年，貴力赤被阿蘇特部和衛拉特部兩部聯軍推翻，更重要的是，這兩個部落並不像其他的部落一樣，一心企圖汗位，他們在殺死貴力赤之後，便第一時間向大明表示了臣服。
在大明的支持下，阿蘇特部和衛拉特部迅速崛起，成爲了蒙古各部當中最強勢的兩個部落。
與此同時，永樂元年，額勒伯克之子本雅失裡重新召集起一支軍隊，宣稱自己纔是黃金家族的後裔，蒙古帝國正統的統治者，並且迅速收服了包括阿蘇特部在內的所有部落，只剩下衛拉特部仍舊在苦苦堅持。
而這個時候，恰是成祖皇帝靖難成功的第二年，獲知此事後，成祖皇帝遣使命本雅失裡上表臣服，不料本雅失裡自恃勢大，悍然拒絕臣服，於是在永樂八年，成祖皇帝親率大軍深入蒙古腹地，幫助衛拉特部擊潰了本雅失裡的大軍。
自此開始，象徵着黃金家族的孛兒只斤氏徹底衰落，蒙古的統治權從黃金家族轉移到了衛拉特部的綽羅斯家族。
但是實際上，本雅失裡雖然被擊潰，卻並沒有死，他和阿蘇特部的首領阿魯臺一同逃亡到了科爾沁部，不料卻被阿魯臺出賣，科爾沁部首領阿臺接收了本雅失裡和阿魯臺的殘餘勢力，然後在阿魯臺的幫助下殺死了本雅失裡。
科爾沁部是成吉思汗的弟弟哈撒兒的後裔，雖然並非嫡系，但是同樣具有黃金家族的血脈，阿臺殺死本雅失裡後，同樣以黃金家族的名義自號爲汗，開始和衛拉特部爭奪汗位。
出於削弱黃金家族影響力的考慮，當時的成祖皇帝在兩方勢力當中選擇了衛拉特部，於是在經歷了數十年的戰爭之後，衛拉特部的首領馬哈木殺死了阿臺，真正成爲了蒙古的首領，並且將蒙古變成了瓦刺。
衛拉特部取得汗位之後，或許是因爲成祖皇帝給他們的印象太過深刻，所以他們並沒有急於和大明翻臉，而是選擇了向東南的察合臺汗國進發，經過數十年的努力，衛拉特部的首領也幾代更迭，變成了一個名叫也先的年輕人手中，在也先這一代，衛拉特終於擊敗了察合臺汗國的衛思汗，強娶了衛思汗的妹妹哈尼木公主。
察合臺汗國同樣是黃金家族的一支，所以也先和哈尼木公主的聯姻，讓衛拉特部也同樣具有了黃金家族的血脈，從此在血統上具備了正統性！
解決了正統性這個對自己最大的威脅，衛拉特部終於騰出手來，將魔爪伸向了大明！
正統十四年，也先向英宗皇帝求娶中國公主被拒，悍然發兵山西，進攻大同軍鎮，英宗皇帝大怒之下，決定御駕親征，雙方於土木堡發生激戰。
大明戰敗，英宗皇帝被俘北狩！
也先曾經一度兵臨京師城下，危急時刻，兵部尚書于謙出面穩定大局，擁立景泰帝繼位，拒也先於城門之外。
雙方對峙數日之後，大明自各地調撥的援軍趕到京師，也先無奈退軍，這便是大名鼎鼎的土木堡之變。
也先退兵之後，心懷不甘，決定釋放英宗皇帝，造成大明內部的混亂，於是遣使與大明議和，送還英宗皇帝，並宣佈自己是大明的屬臣。
再往後，英宗皇帝回到京師，被幽禁數十年之後，最後發動奪門之變，重登帝位自是不提，應當說，也先的陰謀的確成功了，大明的確因爲他送還英宗皇帝的行爲而掀起了一陣腥風血雨。
但是有利必然有弊，也先的這個決定，也同時是他這一生做出的最大的錯誤決定！
爲了順利的送還英宗皇帝，也先宣佈自己爲大明的屬臣，這個舉動引起了蒙古其他各個部落的強烈不滿，正因此事，原本因爲具有了黃金家族血脈而坐穩了蒙古汗位的衛拉特部再度被質疑起其統治的正統性。
景泰六年，也先在諸部落當中兵敗不敵被殺，同年，他的兒子阿馬桑赤臺吉繼承汗位，但是就在這個時候，也先的妻子，也是他當初強娶的察合臺汗國的公主哈尼木發動叛亂，雖然沒有成功，但是經過這次內亂，衛拉特部的勢力大大衰弱。
而衛拉特部衰落下去之後，當初被衛拉特部擊敗了黃金家族又重新崛起，在成化四年擁立成吉思汗的第二十八代後裔達延汗繼位，並且徹底擊敗了衛拉特部，將其趕出了蒙古中東部，自此之後，衛拉特部的時代徹底過去，蒙古的統治權重新回到了黃金家族的手中。
但是衛拉特部雖然被擊敗，卻並沒有消失，而是退出了象徵蒙古汗位的都城哈拉和林，帶領手下的部落啊遷徙到了西部。
奪回汗位之後，達延汗並沒有繼續追擊衛拉特部，因爲他的根基也並不穩固，在他統治的幾十年當中，他先是鎮壓了意圖叛亂的土默特部和兀良哈部，又繼續將衛拉特部趕的更遠，徹底切斷了衛拉特和大明的聯繫，坐穩了自己蒙古大汗的地位。
所以現在大明所稱的蒙古，實際上分爲兩個部分，一個是衛拉特蒙古，即瓦刺，另一個則是達延汗建立的以察哈爾部爲首的蒙古，即韃靼。
不過達延汗雖然是一個雄才偉略的君主，但是他的後世子孫卻並不像他一樣有能力，達延汗死後，察哈爾部逐漸失去了對其他部落的控制能力，淪爲了韃靼名義上的共主，但是實際上，韃靼內部，卻分裂成了三個部分，察哈爾能夠控制的不過是屬於左翼的三個部落而已。
也正是因此，大明自土木堡之變後，才未和韃靼發生過大規模的戰爭，論外敵，韃靼有瓦刺虎視眈眈，論內憂，察哈爾部亦無力管束科爾沁部和土爾默部，自然更是無力大規模進犯大明。
但是如今，既然察哈爾部和土爾默部達成了一致，朱常洛自然要做出對策，後世有一句話，叫做敵人的敵人就是朋友，科爾沁部暫且不說，衛拉特部和察哈爾部可是死敵，只要能夠聯絡上衛拉特部，到時候前後夾擊，縱然是察哈爾部和土爾默部聯手，也未必能夠吃得消！