山本五十六很快就沒有精力來仔細觀察了高空的情況了，因爲有一個大隊的b25進入了俯衝，很明顯是要投下腹部攜帶的魚雷。武藏號戰列艦和其他五艘巡洋艦上的127毫米口徑的高射炮開始“砰砰砰”地開炮，使得黃昏的天空中出現了多多青色的煙團，而軍艦上高射炮密集騰起的發射煙霧則擋住了軍官們觀察的視線。誰也沒有發現空中最早投下的那些“大傢伙”正在迅速地加速，並在初速度和重力加速度的聯合作用之下以拋物線的角度衝着軍艦而來。
風力和空氣的摩擦力似乎並沒有影響到他們，隨着垂直速度的快速增加到700多公里的時速，這些重達兩噸的炸彈表面在空氣的摩擦之下顯得有一些泛紅，那是高溫的表現。武藏號的艦長和聯合艦隊總司令山本五十六幾乎同時發現了空中變得越來越大的炸彈，它們居然跟蹤上軍艦的步伐。
“趕快轉向！”來不及提醒舵手，武藏號的艦長一個箭步衝上去，搶過方向舵就開始用力扳下，戰列艦迅速轉向，艦身甚至開始了傾斜，甲板上的東西滾到了一遍，幾個正在對空射擊的高射炮位上的水兵沒有注意，被拋進了大海。
由於這一次轉向沒有協調好其他艦隻，而現在艦隊由於處於防空陣型而相隔得較緊。突然轉向的武藏號幾乎撞上了它左邊的那艘巡洋艦，好在巡洋艦及時地進行了規避，兩艦的距離最多隻有5米了，涌起的海水漫上了甲板。不過即使這樣，那些越來越大的黑點仍舊帶着巨大的呼嘯聲繼續在接近，山本五十六甚至明顯感到那些黑點也跟着轉了彎，這使得他的瞳孔急劇收縮，這是怎麼回事！難道中國人的炸彈上使得有妖法？
其他艦艇的舵手也在提醒下發現了這個情況，開始紛紛躲避，艦隊的陣型亂了起來，防空火力也不能集中了。混亂的陣型終於釀成了禍害，一艘巡洋艦攔腰撞入一艘小型的驅逐艦，鋒利的艦首將其切成兩截，殘軀的驅逐艦隻一分鐘就沒有要就沉入了大海，只剩下海面上不停呼救的水兵和大量的油污。
能跟蹤軍艦的炸彈的秘密在它尾部的四個翼片，b29轟炸機上的投彈手一直通過瞄準鏡在對其進行遙控。通過無線電控制着炸彈尾翼的角度，使其在空氣動力的作用下一直對準目標而去。這項精確制導炸彈的技術原本是爲了對地攻擊而開發，它是第一代的被動控制技術，目的是利用b29轟炸機進行高空的精確對地轟炸，兩噸重的炸彈可以有效摧毀橋樑，但是前提是得命中才行。有了這種控制技術，投彈手可以一直將準星的“十字”鎖定在目標之上，直到炸彈落在其上。
不過要攻擊艦船，比攻擊地面固定目標難多了，因爲艦船可以做大範圍的機動，而炸彈落到海面的時候已經接近音速，調整的靈活性就差了很多。而且炸彈並不是第二代通過火箭來調整狀態的，是通過尾翼改變氣動外形，調整的距離也是有限的，所以投彈時候的高度和速度也是非常關鍵的。
紛紛落下的重磅炸彈使得“大和”號船團變得混亂了起來，原本阻止攜帶魚雷的b25轟炸機的高射炮火力稀疏了起來，使其順利降低到海面上10多米的高度向日軍軍艦衝過來。
“轟”地一聲巨響，“武藏”號前甲板中部被一枚2噸重的大傢伙命中，這些大傢伙都是爲了對付數米深的鋼筋混凝土工事準備的。原本儲備了100枚，但是沒有想到臺灣島上的日軍根本就沒有用到那些工事就被擊潰了，這一次對艦攻擊，何俊才碰巧想起了這些傢伙，於是就來看看有沒有用，現在果斷地建功了！兩噸重的炸彈在接近音速的動能下擊穿了甲板裝甲，鑽到艦身之中，然後延時引信被激發，劇烈的爆炸將武藏號內部的房間和設施炸得面目全非。從空中看去，武藏號的前甲板上開了一個大大的口子，鋼板捲曲向外，艦艇內部的大火冒到了甲板之上，濃煙瀰漫。
還好武藏號戰列艦內部結構非常堅固，排水量超過了6噸，也有水密艙進行分割，所以動力系統並沒有受損，速度沒有降低下來。那些排水量小的巡洋艦和驅逐艦就慘了。兩枚炸彈命中了同一艘巡洋艦，幾乎將其艦首全部炸飛，露出了內部結構，軍艦嚴重進水，艦長不得不宣佈棄艦。最慘的是一艘驅逐艦，很顯然小小的它原本不是空中轟炸機瞄準的目標，但是由於炸彈落點調整不及，而它剛好鑽在落點之下，炸彈貫穿了上層建築和層層甲板幾乎在底艙才爆炸。巨大的威力使其底部被貫穿，然後將軍艦擡離了水面達到五米，同時海面上也出現了一個巨大的凹坑，兩秒鐘後，幾乎失去了底艙的驅逐艦落到海面之上，砸起了沖天的水花，接着側翻，尾部高高翹起往海中沉下去，兩部螺旋槳還在空中飛速轉動。
三十枚炸彈中一共有五枚命中，以高空水平投彈的角度來看已經很不錯了，畢竟下方的軍艦還在高速機動。之所以武藏號被命中是因爲至少有6枚航空炸彈的目標是鎖定的它，所以儘管親自操舵的艦長已經將其發揮出了最好的水準，但是仍然躲不開被擊中的命運。
危機還沒有過去，山本五十六剛剛從一片混亂的艦橋中站起來，就透過舷窗看見了正在釋放魚雷的b25。每架b25機腹外面掛了兩枚重達一噸的直航魚雷，他們的目標當然不是外面的那些驅逐艦，而是中間的武藏號戰列艦和其他的巡洋艦。
一條條魚雷在接近海面的高度被投放出去，其實這種陸基轟炸機是不太適合承擔這種任務的，因爲它們的體型太大，而面對軍艦，那些自衛火力又發揮不出來作用，所以就在投彈的這幾分鐘之內，就有近十架的b25被擊中，四架直接解體，其他的引擎或機翼受傷不得不提早投放了魚雷返航。這還是在日軍艦隊在航空炸彈干擾之下對轟炸機造成的損失。
剩下的20架b25成功地在靠近核心的位置投下了40條魚雷，魚雷沉入水中，然後又上浮到距離海面數米的高度，發動機開始工作，推動着魚雷以40節的高速向着日軍軍艦而來。
剛剛躲過炸彈攻擊的軍艦再次手忙腳亂地進行規避，可是一公里的距離對於高速的魚雷來說是很近的，海面上白色的魚雷尾跡到處都是，呈扇形向日軍而來。武藏號再次被四枚魚雷命中，劇烈的爆炸使其平移了數米，側面被開了四個大口子，海水瘋狂地灌入軍艦，將剛開始航空炸彈引發的大火給撲滅了。武藏號的水密艙發揮了作用，隔離了損失，但是由於艦身大量進水而傾斜了起來。爲了保持平衡、避免翻覆，武藏號艦長不得不下令在右側注水。這樣一來，艦艇的速度降低到了18節。
兩艘巡洋艦被魚雷命中，爆炸使得其水線以下的部位破開了大洞，巡洋艦上的水兵趕緊進行管損操作。而幾艘驅逐艦爲了保衛後面的戰列艦和巡洋艦的安全，利用自己的機動靈活的優勢衝到了前方，爲其擋住了射來的魚雷，自身則由於經受不起魚雷爆炸而迅速沉沒了。
這一番攻擊下來，使得武藏號船團損失慘重，一艘巡洋艦沉沒，三艘驅逐艦沉沒，另外包括武藏號戰列艦在內的十多艘艦隻負傷。山本五十六看到這樣的情況焦急萬分，他並沒有料到中國人會動用重型和中型的遠程陸基轟炸機來對艦隊發起進攻，這使得他原本的算盤落空了。
就在武藏號船團的水平奮力撲滅大火，封堵漏洞的時候，他們的速度也降低了下來，讓日本海軍感到稍微放鬆一點的是，大和號船團的幾十艘軍艦趕來了，這樣一來對空的火力就變得密集了起來。
大和號上的舵機並沒有修復，仍然需要由兩艘驅逐艦拖拽着它來轉彎。兩支分艦隊不能擦肩而過，於是大和號戰列艦提前開始轉向，並放慢速度以便將就武藏號船團的速度。就在這個時候，天上身下的攻擊機幾乎一股腦地俯衝了下來。不僅包括那一個大隊的尚未投彈的b25轟炸機，還包括塗成了白色塗裝，只有一個發動機的強一天襲者攻擊機。事實證明，更加機動靈活，體型更小的後者纔是最大的威脅。
近90架飛機趁着大和號船團掉頭，而武藏號船團無暇對空射擊的空隙快速降低着高度，從三個方向接近藍色大海上的日軍軍艦。這個時候太陽已經變成了一個深紅色的大圓盤，離海平面只有不到一個巴掌的高度了。天黑前的半個小時，就是決定日軍艦艇命運的關鍵時間。