第66軍和第83軍：從正面的太平門突圍，傷亡慘重，衝出重圍的有3000多人。
第2軍團：因爲是提前過江，脫險者超過11，000人。
警察部隊：南京警察部隊原有6000人左右，過江者不足千人。
憲兵部隊：原有5000人左右，過江的有2000多人。
教導總隊：教導總隊原有近3萬人，按周振強回憶，過江者只有4000多人。
第88師：該師參謀盧畏三回憶，第88師撤至江北的不到2000人。
第87師和其他部隊：脫險者更少。
最後來看，有4萬人左右突圍或渡江成功。譚道平給出的數字是44，000人。譚就職於南京衛戍司令部，親歷南京保衛戰，並參與撤退計劃的擬訂，他的數字具有很大的可靠性。
在12萬左右的中國守軍中，陣亡3萬多，脫險4萬多，剩餘的4萬多（最多不超過5萬人，有價值的初始資料來自日本上海派遣軍副參謀長上村利道的記載，他在12月16日的陣中日記裡說中國戰俘有4萬多人）被俘後遭日軍屠殺。
但也有一些人，在得知南京棄城後，選擇了另一條道路。
教導總隊炮兵連代理連長嚴開運後來回憶起12月12日那天下午的一個片斷：
教導總隊戰車防禦炮連連長顏希儒（黃埔軍校6期，廣西橫縣人）來到嚴開運的陣地要酒喝，嚴把還剩下的一點酒遞給顏，顏一口乾了。喝完後，顏問：如果撤退的話，走不走？
嚴說：上級如果下令，有計劃地撤退，當然要走；只怕危城之下，沒有計劃。
顏希儒說：還能有計劃麼？！
嚴開運問他準備怎麼辦。
顏希儒說：不管怎樣撤，我都不走了。
說着，顏希儒從腰裡掏出兩顆手榴彈，一手拿着一個，說：你看，夠本了吧？！
南京的烈風，刮過這個廣西人的怒發。
在1937年12月12日深夜的下關，裝甲兵步兵炮教導隊第2營軍需官劉樹芃終於上了船，但回頭看到岸上的幾輛坦克和汽車，怎麼能留給鬼子？就想叫人全部炸掉，但身邊的兩個汽車兵和兩個坦克兵捨不得，把劉攔住，僵持中，那四個人說他們不走了。
“不走了”這仨字，在12日夜給人以無限的悲壯。
劉樹芃說：我們是奉命撤退。
汽車兵說：不，我們是打鬼子的，敵人已經到了面前，我們不能把自己的武器銷燬了，應該打了再說。
坦克兵說：坦克上還有武器，破壞了還不如拆下來跟鬼子幹一場。
劉樹芃想把他們帶走，說：你們排長呢，我跟他說。
汽車兵回答：我們自己負責，我們走了。
說完，兩個汽車兵和兩個坦克兵帶了槍，跳下船，重新上了岸。
這，是中國人。
到了13日天亮，日軍已經逼近江邊，一羣失去長官的士兵圍住一個穿上校軍服的軍官，說：我們突不出去了，長官！你指揮我們抵抗不好嗎？否則，也是死。
上校說：我是軍醫，不懂作戰的事啊！
士兵們說：只要您命令我們打就行了！
上校想了想，說：好！隨後他振臂高呼：兄弟們，向鬼子打呀！
這名軍醫就這樣帶着一羣散兵，發起了中國人在南京城下對日軍的最後一次反擊。
沒人知道他們當中有多少人突圍出去。甚至到12月13日下午，還有20多名官兵在挹江門城牆上，狙擊掃蕩過來的日軍。他們也是決定“不走了”的人。
而城陷後，困於孤城的，也有不少人。看下面這個單子：
教導總隊參謀長邱清泉；教導總隊第2旅主任參謀廖耀湘；第72軍軍長兼第88師師長孫元良；第103師副師長戴之奇；第88師作戰參謀盧畏三；教導總隊輜重營營長郭岐；教導總隊第3旅第4團團長睢友蘭；教導總隊工兵團第2營營長鈕先銘；炮兵第42團第1營高炮第3連副連長沈鹹；軍醫署署長兼南京衛戍軍野戰救護處處長金誦盤；野戰救護處科長蔣公榖。上面這些人，都沒逃出去。如果說作爲軍醫官的金誦盤、蔣公榖（著有《陷京三月記》（蔣公穀系南京守城部隊軍醫，擔負城防救護任務。他以日記形式記錄了1937年12月13日至次年2月27日目睹日軍在南京的暴行。原件存中國第二歷史檔案館。））在南京陷城後進入外國大使館，受到直接保護的話，那麼邱清泉、廖耀湘、孫元良、郭岐、鈕先銘、沈鹹等軍人的經歷就可以用“血雨腥風”來形容了。在這些人中，第一個脫險的是第103師副師長戴之奇，1937年年底，他化裝成菜農混出城。其他人，大多數在轉年春天才逃離南京，比如官級最高的孫元良，而且他的經歷也是個“疑案”。
孫元良在第88師打響淞滬會戰第一槍，南京戰時，年僅33歲的他，已升任第72軍軍長兼第88師師長，領中將軍銜。
12月12日傍晚，唐生智下令放棄南京，孫元良參加完會議，返回中華門途中，得知已有日軍突進，孫隻身奔下關不成，一時間不知去哪好，最終困於孤城。關於南京陷落之後的經歷，按孫元良在回憶錄《億萬光年中的一瞬》講述：
我既然在江邊找不着船，只好鑽隙向東面的山地撤退。我們從棲霞山龍譚車站間跨越鐵路，南向進入山區。土族同胞殷情地供給食物，熱心地帶路，並代我們找船，給了我們不少方便，也添了我們無數傷心！這樣，我便帶了我的司令部六百多長官兄弟，和一輩子的創痛與恥辱，從龍譚附近渡江，經泰興、淮陰、徐州、鄭州，於1938年3月下旬到了武漢。
孫元良的旅長廖齡奇不幹了。
當時，廖齡奇帶着從雨花臺下來的殘兵進中華門不成，又找不到孫元良，只好向下關江邊突圍，由於底下的輜重營手裡有一些木船，廖齡奇就帶着第88師的這些人在夜色中渡江了。南京戰中，第88師倖存者中大部分來自廖齡奇的部隊。後來，到了武漢，見到蔣介石，廖齡奇提出槍斃孫元良。
《拉貝日記》在中國出版前，風傳孫元良在南京城陷後藏在妓院，這種說法有點捕風捉影，實際情況是：他躲進了金陵女子文理學院難民所。後來，被拉貝發現（見《拉貝日記》）。拉貝把這位中長安置在了該學院一座樓房的閣樓，使孫元良最終躲過日軍的搜捕，1938年初逃離南京，輾轉抵達武漢。他走脫沒多久，他的部下師司令部參謀盧畏三也逃出南京。
在武漢，孫元良被關了一個來月，進行審查，但最後蔣介石還是放了他一馬。孫元良後來很長壽，活了103歲（2007年去世），是最後一個黃埔軍校1期生。戰爭年代結束後，孫元良漸漸被人遺忘，但他有個兒子，比他名氣大多了，那就是藝名爲秦漢的臺灣演員。
關於孫元良的話題還沒完。
蔣介石不殺孫元良，並不是因爲孫是多出衆的將才，而是因爲從1932年“上海事變”起，孫元良就參戰；1937年“八一三事變”，又是孫的部隊打響第一槍，從這個角度蔣不忍殺。還有，蔣似乎也覺得對不起很多參加南京戰的將士，所以對從南京撤下來的人，無論是怎麼退的，他都不想治罪。孫元良沒被治罪，跟這個有直接關係。
槍斃孫元良是廖齡奇提出的，孫沒死，但1941年，在又一次長沙會戰中，廖齡奇卻因“部隊潰退”（實爲冤案），被蔣介石槍斃了。歷史就是如此奇異。當時廖齡奇在王耀武第74軍，任第58師師長。廖齡奇死後，給了副師長張靈甫獨統一師的機會，這是後話了。
孫元良迷失南京時，邱清泉正待在富貴山地下室。
邱清泉的經歷跟張靈甫相似，一度考入上海大學，但最終棄筆從戎。黃埔軍校畢業後，又留學德國柏林，拿了洋文憑，中日開戰前兩個月回國，出任南京教導總隊參謀長。棄城令下後，桂永清沒把倔強的邱清泉拉走，只好一個人先撤了。邱清泉叫人把作戰文件和軍事地圖全部燒燬後，繼續打電話聯繫前線的部隊長，把身邊很多人都打發走了。
參謀劉庸誠對他說：參謀長，都處理完了，我們也走吧！
邱清泉的身邊此時只剩下兩個貼身衛兵了，他一邊抽菸，一邊往左輪手槍裡裝子彈，對劉說：你受過傷，你先走吧。
劉庸誠百感交集。
劉走後，邱清泉在幾個房間裡轉了一圈，這才提槍帶着兩個衛兵走出地下室，這時候，紫金山第一峰槍聲密集，火光沖天。
這絕對是中國現代史上最冷酷的一夜。
邱清泉把身邊的人都打發走了，但自己終不得出！在地獄般的南京潛伏了一個多月之後，第二年年初，邱清泉才成功逃離。
邱清泉是南京棄城後表現最好的一名將領，真正做到了在那個職位上該做的一切。
跟上面的人比，成名前的廖耀湘沒被困在城裡，而是陷於郊區。
廖耀湘跟邱清泉一樣，也留了洋，抗戰前一年，從法蘭西學成回國，在教導總隊第2旅做了中校主任參謀。南京戰開始後，廖耀湘和部隊跟日軍血戰了四晝夜。得到棄城消息時已是12月13日凌晨。此時廖耀湘在城外陣地，想奔下關來不及了，而且那樣更危險。在指揮室銷燬完文件，廖耀湘用最快的時間判斷了一下路線，隨後帶4名士兵直奔南京外圍的馬羣方向。
一路潛行，天色漸亮，後面仍有槍聲，但較之於前一天，已經稀疏，廖耀湘知南京已陷，不禁心如刀絞。跑了十多公里後，一行人到達馬羣。在馬羣，廖耀湘跟部下不斷遇到逃難的農民。這時候，一個好心的難民，帶着廖耀湘等人去了棲霞寺。棲霞寺位於南京東北22公里處的棲霞山上。當日午後，廖耀湘等人來到棲霞寺。此時，聚集在寺院及周圍的難民已超過萬人。