率部奔赴龍都的過程中，也是代善梳理麾下兵馬的過程，作爲大金真正的核心，八旗永遠是繞不過去的環節。
伴隨着努爾哈赤的身死，兩黃旗從這一刻算起已經是無主之旗，雖然說在這過程中有悍將不服，但是代善他也不是善茬，他與懂得隱忍的黃臺吉有着天地之別，對待那些不服的將領，使用的手段也是最爲暴虐的！
說到底老汗王已經死了，現在不管你們心中是怎麼想的，都必須無條件服從本汗王的汗令！
於是乎在整治的過程中，其順利執掌了兩黃旗，並且按照索尼的諫言，明確汗王統轄的兵馬尊崇，於是乎上三旗就以這樣的方式出現了。
不過和歷史上不同的是，正白旗此番並未當選，正黃旗、鑲黃旗、正紅旗統屬上三旗，等級相同。
同時爲了籠絡大金內部人心，代善便封下了十和碩貝勒，十二固山貝子。
和碩貝勒依次爲：莽古爾泰、嶽託、濟爾哈朗、阿拜、豪格、阿濟格、湯古代、塔拜、阿巴泰、巴布泰。
固山貝子依次爲：德格類、巴步海、碩託、賴慕布、拜音圖、圖倫、寨桑武、費揚武、達爾察、務達海、國歡、尼堪。
因爲莽古爾泰已經率領正藍旗留下了，爲了明確八旗之規模，在此之外，有成立一部正藍旗。
爲真正掌握大金局勢，代善也調動了一系列任命，真正敲定了諸旗名單。
代善掌兩黃旗、正紅旗，嶽託爲鑲紅旗旗主，濟爾哈朗爲正藍旗旗主，阿拜爲鑲藍旗旗主，豪格爲正白旗旗主，阿濟格爲鑲白旗旗主。
湯古代爲草原正黃旗，塔拜爲草原鑲黃旗，阿巴泰爲草原正紅旗，巴布泰爲草原鑲紅旗，拜音圖爲草原正藍旗，圖倫爲草原鑲藍旗，寨桑武爲草原正白旗，費揚武爲草原鑲白旗。
德格類爲漢軍正黃旗，巴步海漢軍鑲黃旗，碩託爲漢軍正紅旗，賴慕布爲漢軍鑲紅旗，達爾察爲漢軍正藍旗，務達海爲漢軍鑲藍旗，國歡爲漢軍正白旗，尼堪爲漢軍鑲白旗。
明確這樣的名單，一方面提升了一些旁系愛新覺羅子弟的地位，諸如拜音圖、圖倫、寨桑武、費揚武他們的地位，這樣會讓他們絕對忠誠於自己。
同時也樹立了矛盾點，諸如年輕的阿濟格，豪格依舊爲八旗旗主，甚至於還被封爲了和碩貝勒，這讓那些年齡大的湯古代、塔拜、阿巴泰他們心裡很不爽啊。
因爲他們從前沒有得到過這些，這在代善當上汗王以後，得到了應有的尊崇，這也就使得他們心中所看的就是眼前的這些，內部競爭、矛盾還是存在很多的，代善的這一手平衡之道玩的那叫一個好。
十和碩貝勒、十二固山貝子的明確，使得動盪的大金很快就恢復了平靜，只是在這過程中被遺忘的卻有莽古爾泰、多爾袞、多鐸、阿巴亥他們。
值得一提的是，阿濟格被代善幹瞎了一隻眼睛，按理說根本就不可能屈服於代善麾下，但是因爲索尼的緣故，使得阿濟格把仇恨居然轉移到了多爾袞身上，反而對於代善是絕對的忠誠，這當真是命運捉弄啊……
當一支支兵馬迴歸，一支支兵馬又重新調度，代善在這樣的過程中不斷凝聚着屬於他的汗權。
而在這段時間內，有超過兩百餘萬衆明人百姓，皆是年輕一代的那種，再加上八十餘萬衆的核心人丁，就這樣一支三百五十餘萬衆的規模，向奴兒干都司地界進發，其中上三旗前往龍都地帶，而餘者皆被調配到不同的地界鎮御。
因爲范文程、寧完我的緣故，使得代善對於明人格外的看重，尤其是在八旗兵馬銳減的過程中，提升草原八旗、漢軍八旗的地位，就是一種很好的策略，因爲這樣可以很好的鞏固汗權。
現階段的代善並沒有大刀闊斧的進行革新，因爲十餘年來都在執掌第一線權柄，本身他在八旗中就有很高的威望，只不過後續因爲一些事情，被努爾哈赤搞掉了昔日的權勢，雖然依舊歸屬於四大貝勒之首，但是權柄在除掉褚英之時減少了很多很多。
但終究是人的影樹的名，代善的權勢雖然被踐踏過，但是隨着上位成功，以及做出的一系列調度，這也使得他的權勢再度迴歸。
這裡需要特別講明的卻是莽古爾泰。
因爲在代善宣佈上位時，莽古爾泰的內心是極其不爽的，爲此他便留在瀋陽要跟明賊一決高下，同時也爲了在八旗中彰顯屬於自己的權勢，爲自己以後迴歸老都，重新奪權奠定基礎。
但是莽古爾泰他怎麼也沒想到的是，當自己一路上爲跟明賊搏殺時，代善已經領着大金能帶走的全部兵馬積蓄都走了，在遼東緊張戰鬥了一個多月近兩個月的時間，遼東的疆域終於還是不出意外的全部被明賊收復。
代善這個狗東西帶走了一切能帶走的東西！
於是乎憤怒之餘的莽古爾泰宣佈就任汗王，而他的身邊除了自己的姻親、子嗣外，也就剩下正藍旗的奴才，大金也在這一過程中分裂成爲了兩部，一部是以莽古爾泰爲首的勢力，一部是以代善爲首的勢力。
只是這樣兩股勢力誰纔是正朔，那明眼人都能看出來，只不過莽古爾泰卻根本不在意這些，就這樣幫助代善吸引注意力……