秦焰的新軍制，實行的是頗爲簡單有效的一種戰時軍制。其實這種軍隊制度，秦焰是根據前世時一款戰略遊戲中得出的靈感，此時卻正好用上。
秦焰的軍制中，以五十人爲一隊，設隊長，這是最基本的編制。之後，兩隊爲一連，設連長。五連（即五百人）爲一營，設營長。十營爲一旅，設旅長。兩旅爲一軍，設將軍。其中營長以下，由所屬單位中所有戰士推舉或選拔擔任，營長以上，則有秦焰親自拔擢。
五萬五千人，被分成了五軍一旅，五軍分別由李廣衡、紀擎天、紀傾城、蘇府蘇郢、韋府韋慕、五人統領。當然，紀傾城身邊，秦焰還安排了林洛兒幫助。
還有一支直轄旅，則有秦焰親自統帥，秦焰相信，這支直轄部隊，在將來的戰場上絕對會成爲一支活躍的精兵。
在劃分的時候，秦焰也有所考量，儘量使得原來的小集團分開編隊，否則的話，這些小集團在新的戰鬥序列中很容易又形成小集體，這對於全軍的凝聚力極爲不易。
由於工程龐大，秦焰不得不從各處借調了一百多名政治人才，經過這些人整整三天的排列，初步的戰鬥序列纔算是頗具雛形。秦焰以“風、林、火、山、雷”來爲五軍命名，同時也是確定了五支部隊的戰鬥方針和部隊性質。
風軍由大將李廣衡率領，孫子兵法雲：“疾如風！”故而，這支軍隊是作爲秦焰的耳目和遊擊兵團存在，在這支軍隊中，秦焰將全軍除了墨軍之外的騎兵共八千人都分配了過去，另外還分配了兩千重弩兵用以射殺地方戰場的槍兵，以掩護騎兵部隊。
一切的情報收集、斥候探報、長途奔襲，遊擊襲擾任務，皆有這支的軍隊擔任。李廣衡向秦焰請教戰術之時，秦焰曾說了這樣一句話：“傷敵於千里之外，索命於須臾之間。”
林軍統帥由心思縝密的紀傾城擔任，並由林洛兒爲副將，孫子兵法雲“徐如林。”故而，這支軍隊是作爲主力兵團之一存在的。徐如林原意是指軍隊步調一致，行動統一，軍陣像樹林一樣嚴整。但是秦焰應用在這支軍隊中，意思就變成了：“諸兵種配合的完美陣法作戰！”
在這支軍隊中，秦焰配置了兩千弓箭手，三千長戟兵，三千重步兵，兩千戰車兵，只要陣法得當，諸兵種配合之間，演繹出的戰陣足以將任何數量均等之敵絞殺其中。
林軍平時以秦焰直轄旅座椅護衛的身份存在的（當然秦焰如此安排多少有些曖昧色彩），而在平原戰場上，林軍將會是主要的戰力。
火軍由性如烈火的老將軍紀擎天擔任，老爺子一身的武藝已經站在了四級頂峰，甚至可以說是半隻腳進入了五級，所以在武勇上自然不用質疑。至於兵法，當了幾十年家臣的紀擎天，又豈會弱於旁人？孫子兵法雲：“侵掠如火！”這支部隊，秦焰配置了大量長刀兵、斧鉞兵、鏈錘兵等殺傷力巨大的兵種，稍嫌不足的就是防禦力和遠程打擊能力略有欠缺。
火軍的主要任務是在短兵相接之時衝擊敵軍，給對方帶來毀滅性的打擊。當然，箭雨對射的階段，火軍裡面只有一千弓箭手，自然也派不上很大用場了。
山軍，擔任秦焰直轄旅的右翼護衛，由蘇氏大夫蘇郢統帥，該軍隊由兩千長槍兵，兩千重步兵以及三千弓箭手，三千重弩兵組成。孫子兵法雲：“不動如山。”僅此一句，足可以體現山軍的防禦能力。任爾橫行霸道，我自巋然不動。
但是秦焰作爲攻擊部隊，防禦力過強的部隊在戰場上的作用反而相對較小，因此秦焰稍加改造，將山軍變爲了防禦力和遠程打擊能力並重的部隊。若是箭雨對射開始，山軍絕對是彼時的主力。
最後的雷軍由韋氏大夫韋慕率領，孫子兵法雲：“動如雷霆”。因此秦焰在雷軍中配備了主要的火器和攻城器械，火槍隊、火炮車、井欄車、、衝城車、投石車等等應有盡有，這支軍隊將作爲攻擊城池的主力。當然，由於其重要性，所以雷軍被安排在最中央的位置，連秦焰的直轄旅都要以護衛雷軍的姿態行軍。
秦焰的直轄旅，則聚集了各部中挑選的精英，包括墨軍五百人，神風營槍兵五百人，王家鐵軍五百人，沈家武卒五百人，精銳弓弩手一千人，精銳重裝長刀兵一千人，重裝步兵一千人。這些人平時的任務就是保護指揮中樞，但是關鍵時刻，他們可以發揮的戰力，絕對不遜於任何一支萬人的軍隊！
軍隊全部編制完畢後，秦焰長出了一口氣。攻伐南宮，這準備工作就如此的繁重，以後的戰爭，其困難度也就可想而知了。
就在所有戰士就位的第二天，秦焰又進行了一次全軍的集合。
這兩天秦焰除了編制部隊之外，主要的做的事情就是和這些下級戰士進行溝通，基本都到了同吃一鍋飯的地步。秦焰本人年紀雖輕，但有着六級武士的實力，說話又不拘小節，很快就贏得了這些士兵的好感。
故而這次集合，大部分士兵對秦焰的感情就和上次不一樣了，上次秦焰是用威勢壓住了衆人，這次，卻是以低姿態博得了衆人的好感。
見秦焰走上城頭，城下的士兵們有不少都自發起立，向秦焰致敬。
秦焰笑着道：“各位，這兩天過得可好啊？”
“好！”經過幾天的融合，衆士兵也沒了剛開始時的不適應。
“好他娘什麼好。”秦焰笑罵道，“三天才見一回肉，老子嘴裡都快淡出鳥來了。”
秦焰的話立刻引起了士兵們的陣陣笑聲，只覺得這位小將軍說話頗對胃口。
秦焰笑道：“從今天起，進入正式的訓練階段。每營我都給你們安排了一個教官，具體怎麼個練法，他會告訴你們。你們好好練，成績好的，我讓他天天有肉吃，但是哪個敢消極偷懶，連口湯老子都不給他喝！不光這樣，老子還得拿鞭子抽他，爲什麼？懶驢不抽不使勁！”
話音剛落，又是一片笑聲。秦焰心中暗笑，你們現在就安逸吧，一會兒有你們哭的。
秦焰神色一肅：“好，下面先來個熱身！全軍列隊，繞着北盟城，三圈，跑步，走！”
此言一出，頓時士兵們齊齊發出了哀嘆。北盟城一面城牆就有四里多地，繞三圈差不多也有五十里，這，這他孃的是熱身？
秦焰此時卻是笑道：“你們可要抓緊時間，過了飯店再回來，可就沒飯吃了啊！”說完，秦焰臉色一變，大喝道：“還不跑！”
一句話如同驚雷，這些士兵渾身一震，立刻邁開大步，向前急衝而去！
看着這些士兵衝鋒一般的速度，秦焰冷笑道：“哼，按照這種速度，你們要是能完整跑三圈，我就讓你們當統帥。”