在原作中有些人在這場戰爭中死去了，但是現在這些人都活了下來，像是月光疾風原本該在發現砂隱和音忍勾結的時候，被馬基給殺死了，但是現在，月光疾風的任務發生了改變，他的命運也隨之改變了。
還有這場戰爭中木葉最大的犧牲原本是三代火影的離世，現在也被改變了，和大蛇丸戰鬥的變成了止水，而三代也沒有因爲要封印初代火影和二代火影而將自己獻祭。
不過沒發生改變的是在這次戰爭之後，三代火影要退位了，他越發感覺自己力不從心了，已經無法再保護木葉了，雖然他的實力和身體恢復到了巔峰，但是在他看來，木葉是該發生改變了，而最大的改變就要從自己這個火影做起。
何況本來就說好了要讓綱手來繼承火影的位子，他只是暫時代理而已，現在已經過去十多年了，也是時候退位了。
“日斬，你真的決定好了麼？其實你做的已經很好了！”
火影辦公室中轉寢小春看着三代火影問道。
“是啊，日斬，這次的戰爭我們的損失並不大，雖然有不少房屋被破壞了，但是砂隱那邊也賠償了，其實你可以不必退位的啊！”
水戶門炎說道。
“我意已決，本來我就是暫替綱手，現在也到了退位的時候了，村子想要進步，就要有一個新的火影帶領，我雖然不在當火影了，但是我一樣可以爲村子做貢獻，況且我年齡也大了，到了該退休的時候了！”
三代火影說道。
“好吧，既然你這麼說，我們也尊重你的決定，能夠由綱手來繼承火影之位，也是不錯的選擇，只是你知道綱手在哪裡麼？”
轉寢小春見三代火影已經下定決心了，便不再勸說。
“有個人肯定能夠找到她，我會將這個任務交給他的，其實本來由他來當火影也是非常適合的，只不過他拒絕我多次了，明確表明不願意當火影，但是願意一直守護木葉。”
三代火影說道。
“你是說自來也麼？他的確比起綱手來更適合當火影，只不過他的性子太散漫了。”
水戶門炎一聽就知道說的是自來也。
自來也在外漂泊很多年了，一直都很少回村子，要麼是在追查大蛇丸的下落，要麼是在打探那些威脅到村子的組織，他一直都以自己的方式在保護着村子，可以說，雖然自來也不願意當火影，但是卻實實在在做到了火影該做的一切。
只不過自來也懶散慣了，讓他當火影，將他捆綁在火影辦公室裡，還不如殺了他，更何況當了火影的他，還怎麼進行寫作收集素材啊！這纔是最重要的！
“自來也，給你個任務！”
三代在和轉寢小春和水戶門炎討論完之後，叫來了自來也。
“老頭子，什麼事？我還有重要的素材要採集呢！況且，那個老不死醒來了，我得趕緊跑路了！”
自來也說的老不死就是羅根，他被羅根折騰個夠嗆，實在是不願意再面對羅根了。
“對羅根大人要尊重些！你有今天的成就，羅根大人幫了你很大的忙！”
三代火影皺着眉頭說道。
“好啦，我知道了，到底是什麼事？沒事我走了啊！我得被他抓住之前離開！”
自來也不耐煩的問道。
“綱手也該回來了，當初答應讓她離開一段時間，一轉眼已經過去十多年了，你現在就將她帶回來，火影的位置該傳給她了，本來是傳給你更合適的。”
三代火影說道。
“哦？老頭子你捨得退位了啊！我還以爲你準備幹到死呢！”
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自來也有些意外地說道。
“說什麼呢你，早在十多年前我就準備傳位給綱手了，只不過那時候繩樹剛被大人復活，綱手要陪着繩樹，所以我才暫替綱手的，現在時間過去這麼久了，繩樹也成長起來了，是時候讓綱手接位了！”
三代火影不滿的說道。
“好吧，我知道了，這個任務我接了，不過我要帶一個人一起去！”
自來也摸着下巴說道。
“誰？”
三代問道。
“鳴人！”
“你要知道曉組織的目標就是鳴人，你確定要帶鳴人出去麼？”
“帶着鳴人不光可以讓危險遠離木葉，同時還可以訓練鳴人掌握九尾的力量，畢竟當初水門將九尾封印在鳴人體內就是爲了讓鳴人掌握這股力量來保護村子，現在也到了該教導鳴人的時候了！”
自來也解釋道。
“可是，鳴人現在能夠做到麼？九尾是天下怨氣的集結體，你確定鳴人不會受到影響麼？一旦鳴人失控，九尾破開封印，那麼不光鳴人危險了，你也會非常危險啊！”
三代擔心的說道。
“我在鳴人身上看到了比水門還要堅韌的品質，如果講有誰能夠掌握九尾的力量，也只有他能做到了，更何況，雖然那個老傢伙雖然很可惡，但是也給了我不少手段，足夠可以控制失控的九尾了！”
自來也撇撇嘴說道。
“羅根大人傳話了，讓你在找完綱手之後，去他那裡一趟，他說有些事情需要你知道了！大人當時的表情很嚴峻，可以看出情況很嚴重！”
三代火影面色凝重地說道。
能夠讓羅根那麼凝重的事情一定非常不簡單，三代問過什麼事情，羅根只是說還不到他知道的時候，只讓自來也到時候去他那裡一趟。
“是麼？能讓老傢伙這麼嚴肅的事情，還真不一般啊！等我回來之後，我會過去的！”
自來也嚴肅地點點頭說道。
不管有沒有這件事情，自來也都需要去找一次羅根，因爲他發現了一些不尋常的事情，而且以他的實力竟然無法查到對方的一絲蛛絲馬跡，這讓自來也非常不安。
“好，那你速去速回！綱手就拜託你了！讓她儘快回村子主持工作，還有，一定要小心保護鳴人，鼬傳來的情報你也看過了，曉組織的目標是所有尾獸，而且他們的步伐也加快了，據鼬推測，他們很快就會對鳴人下手了！”
三代火影抽了一口煙之後說道。
“放心，有我在，不會讓鳴人出事的，我先走了！”
自來也說完之後就離開了火影辦公室。
“還真是個多事之秋啊！什麼時候和平才能真正降臨啊！”
出了火影大樓的自來也看着遠邊的天空喃喃自語道。