軍隊正規化的工作還在繼續，嚴查貪污腐敗，整肅軍容軍紀，太平軍一口氣又頒發了幾個新條例。並且已經着手安排軍銜制度，新的參謀團隊很快就上了正軌，在一次又一次的激烈的爭吵中找到了自己工作的節奏，在這一批人中，高俊特別看好兩人。
丘真，贊州壽張縣人，最早的第一都成員，參與過反擊時全、中都事件、魯南戰役、蘆葦蕩反擊戰，負傷後退出現役，轉爲莒州沂南縣縣尉，去年冬季戰役期間，率領沂南縣民兵隨同主力隊伍轉戰，全軍被轉入現役正軍，重新就任軍使，本次對調後進入陣部，擔任營寨參軍。
左鐵郎，沙州敦煌縣人，跟隨李朱羅從西夏進入金境，參與過南征戰役，在胥浦橋之戰立功，被授予軍佐之職，在去年冬季戰役，柳充國陣亡之際，率領殘部堅決突圍，因而就任軍使，本次對調後進入陣部，擔任保衛典史。
兩個人有着不同的性格，修真相對憨厚，做事情非常上心，在別人吃肉的時候，他也願意去啃骨頭，相比而言，左鐵郎心思多一些，善於揣摩別人的意圖，但關鍵時刻也能下定決斷。
這兩個人在目前的參謀系統中屬於佼佼者，在他們倆的突出貢獻之下，高俊就軍隊正規化，又做了許多工作，其中最重要的還是軍銜系統。
中國自魏晉以來就有5成的關節系統，從正一品到從9品一共18個等級，一靠年資和功勞逐級上升，到宋代時，升遷已經有了一定之規，門檻要求已經十分完備，高俊當然要伸手拿來，在這個關節系統上，往下延伸已定成績納入整個軍兵系統。
根據該系統，太平軍的指揮層級很快確定爲
正三品太平軍總指揮（高俊目前是節度使，剛好是正三品）；
從三品軍事委員會委員
正四品陣將軍
從四品
正五品營統制、陣副將軍、軍事委員會各曹主事
從五品陣長史、陣總判、軍事紀律委員會委員
正六品旗指揮、營副統制、軍事委員會各司科長
從六品營長史、營總判、陣佐史、陣助判、陣醫院院長、陣軍樂隊（文工團）隊正
正七品都軍使、旗副指揮、陣參軍、陣典史、陣判官
從七品營佐史、營助判、陣直屬隊隊正
正八品都軍佐、旗典史、旗判官、陣直屬隊隊副、營醫院院長、營軍樂隊（文工團）隊正
從八品營參軍、營典史、營判官、
正九品都軍典、都軍判、營直屬隊隊正、陣將軍司吏、陣將軍禆將
從九品營直屬隊隊副、陣副將軍司吏、陣副將軍禆將、營統制司吏、營統制禆將
特級軍士陣什將、陣將軍傔從、陣將軍書手
一等軍士營什將、陣副將軍傔從、陣副將軍書手、營統制傔從、營統制書手、陣公使、陣承局、陣押官
二等軍士營副統制傔從、旗什將、營公使、營承局、營押官
三等軍士虞侯、旗公使、旗承局、旗押官
四等軍士隊正、優秀資深軍兵、都什將、都承局、都押官、騎兵貼軍草頭、廄頭、淨頭、主計運輸護頭、匠頭、庫頭
五等軍士隊副、資深軍兵、騎兵、技術工兵、主計運輸車頭
六等軍士軍兵、繡工、主計運輸車副
一等卒貼軍書記、貼軍支應、
二等卒貼軍差人、貼軍
高級學員五至九年級少年軍成員
初級學員一至四年級少年軍成員
普通士兵分爲十一級，而軍官全部被納入了官員體系，與此同時，按照規定，騎兵軍官的軍銜會比步兵軍官高半級，而貼軍軍官則比步兵軍官低半級。
在制定這項制度的時候，丘真和左鐵郎花費了大力氣，用算盤噼裡啪啦打出了各級軍官的人數和未來升遷路線可能遭遇的障礙，一點點微調着軍官等級，終於達到了相對平衡。
在高俊的要求下，各陣、各營的軍醫、軍樂、教員、斥候、力畜、材官、軍法、軍旗八個直屬隊（更準確的說，醫隊變成醫院，軍樂隊變成文工團之後，變成了一院一團六個直屬隊）的成員沒有固定級別，而是根據自身技能不斷考級，他們的級別被稱爲專業級別，而不是指揮級別。
營醫院一名參加過魯南戰役的老軍醫可能直接考中一級軍醫，享受正七品待遇，而營醫院院長也才從八品，但是在軍事作戰中，軍醫依舊要聽從院長的指揮。
從軍兵到軍官的跳躍將變得困難不少，雖然說英雄不問出處，但是從軍兵到軍官，從初級軍官到中級軍官，從中級軍官到將軍，高俊還是牢牢的卡住這三個坎，絕不能僅靠混資歷就混上去。一半以上軍兵大概會熬到五級軍士左右就退伍，優秀的成爲四級軍士乃至三級，只有極少部分人會繼續提高。
想成爲軍官，只剩下幾條途徑：
一、優秀軍校學員
烈士遺孤可以直接進入少年軍校，與此同時，少年軍校也分配部分名額面向社會招生，考入之後即編入少年軍，授予學員軍銜。在學員中表現出色的成爲少年軍軍官，達到合格年齡之後，少年軍會轉化爲貼軍，而在貼軍服役一到二年之後，又會轉化爲正軍。而這些少年軍官自然也依次轉化爲正軍軍官，李驍奇目前走的就是這個路線。
二、文資轉授和歸順軍轉授
經由軍事委員會委員批准之後，可以將文資官員（比如民兵部隊的首領）轉爲太平軍軍官，而向太平軍投誠歸順的各路勢力軍官也依照此辦法進行轉授。
三、蔭補撫卹軍官
蔭補自古有之，同樣，太平軍軍官也可以按照其官職來蔭補一名家族子弟進入軍隊，如果軍官犧牲，其子弟如果提出要求，也可以錄入軍中。但是這一類軍官提升很慢，而且往往遭受非議。
四、技術路線
八大特殊兵種的成員如果專業級別已經達到了軍官級，在主官空缺的情況下即可充任直屬隊的隊正，這樣也可以進入軍官級別。八大技術兵種本身就比較容易進入，從這條路線進入軍官也不算難。
五、立功受獎
軍兵們如果表現良好，爬到三級軍士以上，就有機會成爲首長們的護衛，一般而言，以一級軍士或者特級軍士的軍銜護衛首長達到規定期限之後，重新外放時就會升一級爲軍官。高俊這麼做，也等於是默許了手下營級以上的軍官們搞搞自己的小關係。
七、武舉
朝廷有武舉，高俊也已經開始籌備在根據地境內的開科取士，軍兵乃至軍官都可以參加武舉，一旦金榜題名就將授予官資，之後可以選擇成爲地方治安官（如縣尉）路線或者是軍官路線。選擇軍官路線的話就要進入軍官進修班，畢業之後則安排職務。