嚴嵩有兩張臉孔，見皇帝媚態可掬，見下屬威嚴十足；高拱也有兩張臉孔，見下屬悍態畢露，遭貶謫魂飛魄散。宣畢諭旨，衆臣皆散，高拱仍癱在地上，一臉茫然。幸張居正及時返回，將高拱掖出乾清宮，高拱醒悟過來，想起諭旨中“不許停留”之句，便即刻回府打點行裝，準備返鄉。韓楫之流，嚇得屁滾尿流，人面不見。還是張居正講點人情味，他上書少年皇帝萬曆，請求予高拱“馳驛”回鄉，以存體面。見張居正如是說，萬曆自然無話。
離京之日，高拱修書一封致徐階稱：“我本無報復之心，而世人不理解我，都說我睚眥必報……往事如夢，黃粱已熟，一嘆一笑而已。”
徐階的復書十分簡單，道“往年叨冒過甚（太盛了），庚、辛（海瑞巡撫應天，蔡國熙任職兵備副使）間諸患（衆多大難）都是自招，幸賴主上明聖，得脫塗炭，今只一味感恩，不敢尤（責怪）（別）人。”前後兩任首輔之書信交往，就此中止。
高拱被逐，內閣由張居正出任首輔，徐府的舊案，一概中止。削籍（三子被奪職爲民）、充軍、沒收田產等舉全都撤銷，徐階攜三子修整門戶，約束子孫，恢復了平靜的退休生涯。只是想起遭難期間六個孫輩無人照料而橫遭夭折，仍不免心疼。而那高拱回到河南新鄭，到家廟祭奠，卻遭到堂兄高捷的一陣斥責：“你身居相位，致使朝中彈章交劾，有何面目來見父祖？”滿臉羞慚的高拱無言以答。
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張居正執掌大權，徐府的境遇無意中得到改善，追隨高拱鞍前馬後的韓楫、宋之韓、王元賓輩，不僅沒撈到任何政治資本，反倒露出鷹犬的面目，自慚形穢，從此偃旗息鼓。至於應天巡撫、巡按，蘇鬆知府等各級官員，也不敢輕易騷擾，彼此相安無事。而徐階本人，則已閱盡世情之冷暖，厭倦宦海之惡鬥，再也不去關心朝中之事，只求“使獲安寢，飽食于山林，即至幸矣”。
在教育子孫嚴禁張揚驕奢等種種邪心之餘，徐階的蹤跡出沒佘山慧日寺、廣富林知也寺、東門外的修身庵，與圓寶和尚、小知也、四空品茗參禪，詩棋相娛，頗爲自得。
萬曆二年（公元1574年），長房長孫徐元春赴京應試中了進士，舉家大喜，但徐階處之泰然。松江府、華亭縣皆欲前來賀喜，徐階一概謝拒：“劣孫僥倖得中，不敢勞動父母官玉趾；尤不當啓劣孫驕奢之心。敬祈諒鑑！敬祈諒鑑！”遭難時爲數不多的雪中送炭的親朋、避之猶恐不及的親朋，都一齊擁來致賀，徐階開門延客，待以酒食，賀禮一概拒卻。赴京以後，徐元春授任刑部，徐階憂心忡忡，似乎從孫兒的身上看到了自己的影子，自己如此傾心爲國，致仕後連遭大難，宦海險惡，吉凶莫測。徐元春赴任前晚，老眼昏花的徐階學自己的祖父，給孫子揮筆寫了銘語三條：“毋躁進，毋上人，毋標榜立門戶。”徐元春敬受，赴任後就將此三語置於座右，朝夕諷覽，率循維謹”。
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到了萬曆六年（公元1578年），高拱去世。同年正大刀闊斧推行改革的張居正的父親去世，擬告假回籍守制，又恐繼任者不良於事，致轟轟烈烈的改革大政擱淺，便修書一封，馳送恩師，有意請恩師出山，再任首輔。這是徐階恢復名譽的極佳機遇，但徐階厭倦了，復書婉拒。以致張居正不得不“奪情”，也就是因國事緊要而不返鄉守孝，繼續任職，留下戀棧的話柄。