末日來了，不打招呼。人類面對這種突如其來的情況，並沒有任何的預案，就算是神經元也沒意識到末日會是以寒冬的形式降臨。凜冬將至，萬物皆亡，甚至連eva都要被凍結了，寒冷真的是萬物的大敵。
情況很是糟糕，不過當神經元的人來到學校之後，卻發現學校並沒有多少問題，有足夠的食物，也有能源保持溫度。一羣大人都被寒冷打敗了，但幾個孩子卻能繼續用科技獲得資源，真的是不可思議。
果然還是因爲杜蘭麼？大家心裡想着。
當大人到來，少年們顯然不是很歡迎。因爲在他們看來是大人們背叛了世界，才導致了末日。大人們則是認爲正因杜蘭帶着學生搗亂才導致了變化，特別是第一次衝擊光線這種不應該存在的力量纔是最大的錯誤，導致了世界不可逆轉的坍塌。
雖然沒有證據，但作爲人他們本能地把責任推給對方，而不是承認世界毀滅與自己的行爲有關係。反正就算承認，也要說雪崩之下沒有一片雪花是無辜的，自己有錯別人更有錯，反正不是自己一個人的錯，要錯大家一起錯。
所以雙方僵持不下，都不爲末日負責。
碇源堂站在所有人的面前，看着杜蘭說道：“一切都如你所願。”
“瞧你這話說的，之前在我的教導下，eva駕駛員接連打敗了使徒，你們可不是這幅嘴臉。怎麼現在世界不斷降溫，眼看沒希望了，你們就覺得是我和駕駛員的錯了？還真是放下碗就罵娘，卸磨殺驢，過河拆橋，你們的良心不會痛麼？”杜蘭表示大家看看，神經元果然是要出賣駕駛員了，果然是要讓駕駛員背鍋了。
碇真嗣也很失望，沒想到自己的父親如此沒有擔當。其實碇真嗣比父親強多了，畢竟碇真嗣趕鴨子上架拯救了世界，而他的父親碇源堂只知道爲了愛人而算計世界，只是爲了自己。
“如果不是你的加入，一切都會很順利。”碇源堂現在也是無能狂怒，畢竟自己的計劃完蛋了，他再也不可能見到愛人了，必須把這股無明火發泄出去，杜蘭就是最好的目標。
一旁的渚薰知道杜蘭確實是個意外，之前的輪迴並沒有見過杜蘭，不過在此見到碇真嗣還是很高興的。渚薰本來也是爲了爭奪融合的主導權，但被碇真嗣的真誠感動，後來就一直在幫碇真嗣。雖然總是幫一半就被殺死了，不過死亡也是幫助，至少給碇真嗣減少了一個競爭對手。所以死也是一種幫助，渚薰如果不早點死，最後就是他和碇真嗣進行競爭了，兩個好基友肯定會很傷心難過。
不過渚薰的死每次都對碇真嗣造成了巨大的打擊，
因爲渚薰是碇真嗣失去各種朋友之後的支柱。是綾波麗犧牲，明日香被污染，鈴原東治受傷等等事件之後的支柱。這感覺就好像碇真嗣是天煞孤星一樣，每次他交了朋友，建立了友誼，最後卻會被剝奪。後來和渚薰交好的後果更嚴重，導致自己必須親手殺死渚薰，或者是親眼看着渚薰死，反正就沒有一個人能陪伴他到最後。
劇場版裡不同的就是多了一個真希波陪伴碇真嗣到了最後，所以碇真嗣最後選擇了美好的重啓，一個沒有使徒，沒有eva的新世界。
真希波看起來是少女，但內心卻是阿姨。哪個少年人能阻止溫柔可愛又會關心人、同時成熟穩重的真希波呢？反正碇真嗣不能，當然不一定是和真希波成爲愛人，也可能是單純地把她當做姐姐、母親、朋友、老師、家人，甚至是自己成長的目標。
整個作品看下來，除了加持良治之外，也就真希波的人格算是健全。
簡單來說其實補完計劃就是心和體的同步，就是健全的人格。神經元的這羣大人，有名有姓的幾個都不正常。碇源堂就不用說了，妻子是真愛，兒子是意外，沒有一個父親的人格。葛城美里看似穩重，其實極度戀父。赤木律子和上司有不正當關係，而且和母親喜歡同一個人。還有幾個員工，有暗戀上司的，有喜歡同性的，反正都很難說健全人格。
心和體根本就是脫節的，就好像駕駛eva的少年，光有強大的身體和技能，內心卻軟弱和殘缺。
其實也很正常，因爲他們一直以來接受的是‘成爲你自己’的教育方式，整個seele的運作可以說是‘認識你的本質，並讓他來決定你’，既然本質就是‘人也是使徒’，那麼人就應該和使徒一樣追求融合。
認識自己，卻不改造自己，只是放任自己的缺點，甚至是讓缺點來決定自己的行爲動機。所以這種思想本身就不是爲了建造健全的人格而存在的，看中的是個人能力的展現，至於人格是無所謂的，不在考慮範圍之內，而且這個過程中其他人的加入也並不重要。Seele就是這樣運作的。
但個人的展現需要他人的加入，碇真嗣之所以覺得很苦惱，其實就是因爲他並不想認識自己的本質，他想要通過人際關係來進行思維，簡單來說就是他孤單寂寞冷，渴望朋友，試圖通過人際關係來建設屬於他自己的人格。
整個神經元系統中，看似少年是最自閉的一個，其實他的自閉完全是因爲周圍人的自閉纔會特別明顯。在學校裡，少年也挺正常的，就是有點害羞和內向。
到底是‘認識你的本質，並讓他來決定你’；還是‘人作爲其他人中的一員’去追求豐富、完美的精神生活。
前者並不需要改變自己，而是隻要通過自己的學問去工作就行了。而後者則需要花費更多時間和精力去做到學、思、知、信，觸類旁通，不僅僅專業知識強大就行，還要通曉人情世故。
學，是繼承和掌握。思，是反思和創新。知，是分析和預測。信，是能力和承諾。通過一系列的學習和實踐，最後才能建立健全的人格，不但業務能力強大，而且還能成爲一個可以被依靠的大人，纔算是真正的人格健全。
真希波，加持良治都是。其他人就不是了，少年在杜蘭的教育下也正在朝完整人格的方向進步。一旦有了完整的人格，他們就不會覺得人和人隔離了，他們會熟練地處理人際關係，不會再覺得和人交流是一件壞事了。
知之不如好之，好之不如樂之。知道一個道理，不如愛好一個道理，愛好一個道理不如從這個道理的實踐中獲得快樂。杜蘭表示神經元的這些大人差遠了，也需要教育。
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