肖林還不知道的是，這個世界上，已經出現了一個勢力，將他和他的新美洲王國視爲了絕對大敵。這個實力，就是歐洲上空的陰影，中世紀的統治者，王權上面的牢籠。好吧，其實就是教會。教會自從發現肖林庇護了自由刺客聯盟之後，就對肖林有着一些敵意。本來要是肖林不惹事，他們也不至於大老遠的和他過不去，畢竟在新大陸他們的影響力實在有限。
可是，沒想到肖林是一路作死啊。不僅僅庇護了自由刺客聯盟，還把他們捧到了高位，主動選拔人員加入自由刺客聯盟。不過，這是他們眼中的，在肖林看來，他只是讓這幾個專業人士幫忙訓練一批間諜和特工出來。不過人家可不這麼看，他們百分百確定，什麼間諜特工都是假的，主動幫助自由刺客聯盟纔是真的。
後面這些培訓出來的間諜和特工一部分參與了兩次對聖殿騎士組織的圍剿，他們更是確定了這個想法。等到他們認真去了解公司之後，他們發現，這個公司居然是比自由刺客聯盟對他們大業壞影響還要大的勢力。公司提倡自由平等，鼓勵科學研究，整個社會都充滿了自由美好的氣息，除了一個太陽神，甚至全面否定其它的神靈。
這其中，沒有一個是他們能夠原諒的。教會認爲，過度的自由只會導致墮落。沒有被約束的人們，只會陷入無窮無盡的紛爭當中，從而導致無窮無盡的戰爭。這在以往的歷史中已經證明了，他們確信不會出錯。所以，他們覺得，必須有一個絕對強大的勢力統治人們的思想。自然，他們認爲自己就是當仁不讓的人選。
可是公司不僅宣揚自由，還鼓勵自由。更甚至，公司的科技實力已經遠遠超過了他們。最讓他們不能容忍的，可能就是公司全盤否定上帝的存在了。肖林爲了擺脫天主教基督教對白人們的影響，爲了防止以後教會一個呼籲就出現一批白人起來反對他，他可是想盡了辦法證明上帝的虛假性，一些證據被僞造出來，效果還是非常不錯的，就是把教會可得罪慘了。
教會已經把炎黃貿易公司視爲了生死大敵，可是肖林卻完全不知道。歐洲並不是公司未來的重點，肖林從來沒有打算攻上歐洲，自然不會再那裡多浪費時間。阿列克謝他們培訓出來的間諜和特工，肖林也派了一些回到歐洲，不過都在英國、法國、西班牙、葡萄牙四個國家裡面，根本沒有把目光放到教會身上去。阿列克謝他們也是懈怠了，公司的強大，給了他們巨大的安全感，已經不把教會放在眼裡了。
自然，他們也就沒有提醒到他。肖林倒是發現了聖殿騎士們在搞事情，但是他只知道他們是白人，並不知道他們是聖殿騎士，他還以爲是一些對他趕跑英法，佔據北美不滿的兩個國家的人。當時科爾森因爲帶隊襲擊阿帕奇方面軍的炮兵陣地沒有成功被打了一個反埋伏，因爲知道回去沒有好下場，就此離開戰場，提前回到了手下所在的部落裡，找了個藉口把手下全都帶走了。
科爾森並不甘心就此回到歐洲，雖然他不會受到什麼處罰，但是驕傲的他不允許自己一直失敗。所以，他帶着自己的團隊來到了加勒比海灣。這裡，有教會的隱藏力量，他要靠這股力量，在海盜當中崛起，積攢更大的力量，不斷地拖延炎黃貿易公司強大的步伐。教會有一些人僞裝成海盜，一直在這裡活躍，一是爲了埋下暗筆，二也是可以通過劫掠爲教會提供一些資金。
科爾森畢竟是從小培養的聖殿騎士，實力和戰略指揮能力並不差。如果不是因爲公司太過團結強大，他也不至於落到這個地方。短短時間，這個三艘船，三百多人的海盜團就被他完全降服了。然後，依靠這點力量，他開始瘋狂地擴張。也得虧他運氣好，這個時候，沒有人再關注海盜們。英國法國都被趕出了殖民地，在這裡已經沒有了利益。
西班牙和葡萄牙要不了多久也會把殖民地移交給公司，也沒有閒心去管這些海盜了。肖林因爲是大國出生，從來沒有感受過海盜的力量，自然也不會把海盜放在眼裡。海盜不招惹他他也不會去管他們，敢伸手不要說手，就是腦袋都給砍掉。伊吉克帶着艦隊幾次出擊後，也就沒有了海盜敢招惹掛着公司旗幟的船。
所以，科爾森完全感受不到外界的阻礙，瘋狂地增長了實力。在肖林建國儀式前一個月，他的實力已經到了事兒艘船，上千員海盜的地步。科爾森覺得這個實力已經不錯了，短期內沒有辦法再增長了。所以，他開始準備給公司添堵。剛好他的團隊裡一個人從一個喝醉的西班牙海軍嘴裡得到了公司的武器物資支援的事情，科爾森就動了心思。
不過，西班牙人每次都是五艘巡洋艦護航，他們十二艘海盜船，不少還是武裝商船，就算打過了，也會付出慘重代價。所以，他就想到了一個調虎離山的計謀。他先是集中力量洗劫了一個西班牙沿海小鎮，引得西班牙人來追殺。然後故意露出破綻，讓自己團隊裡的快船都暴露出來，然後靠着對航路的熟悉和船隻的快速，把西班牙海軍給調開了。
然後，他還聯合了一個無法無天而且有點走投無路的海盜團，一起襲擊了兩艘運輸船。雖然因爲這次運輸船隻有兩艘，運輸的貨物並沒有以前那麼多，但是也讓他們以極快地速度完成了戰鬥。兩艘船隻是運輸商船，有些護船火力，但是並不能阻擋十幾艘海盜船。兩艘船的物資，另外一個海盜團只對食物和一些衣服感興趣，覺得是奢侈品賣得出去錢。
而科爾森，也只對上面的霍爾M1819步槍和重拳一式火炮感興趣。他知道這兩種武器的厲害，就是沒有渠道去接觸，以前英國人放着他們，現在炎黃貿易公司更是嚴防死堵。這次獲得了一批，他立刻收了起來，拿出三分之一運到歐洲總部進行仿製研究，剩下的他都裝備上了。科爾森還以爲這種事情並不會驚動肖林，還打算繼續幹下去。
不過誰叫他的思維跟不上呢，肖林的思維是21世紀的華國思維，講究“犯我中華者，雖遠必誅”。而他是18世紀帶着點中世界影響的思維，以爲上位者都不在乎平頭小民的死活。只是幾個軍隊中的士官，他認爲應該不會讓公司大舉出動。倒是西班牙人，可能會更加努力追殺他們，不過並不被他放在眼裡。
他還不知道，伊吉克已經親自出馬了。完成任務休息了幾個月，同時完成了剩下的訓練的黎明之光戰隊再次出動，他們來到海軍營地，登上了公司艦隊旗艦-“起始號”，也是一艘來自21世紀近四千噸的驅逐艦上。伊吉克就是起始號的艦長，也是這次行動的指揮官。肖林要求他找到兇手，全力解救公司支援給西班牙人的教官，如果必要，讓他完全不必顧及海盜的性命。也就是說，只要完成任務，他大開殺戒肖林也不管。
伊吉克好久沒有接到這種任務了，渾身上下的血液都沸騰了起來。他從來都不是一個好人，更何況要對付的是壞得流膿的海盜。他立刻把所有沒有出任務的戰艦都給擊中起來了，給自己挑了十九艘戰艦。其中四艘導彈快艇，五艘獵潛艦，十艘飛剪船。全都裝備了公司最新的艦炮和20世紀華國製造的艦炮，火力極其強大。
二十艘船，更是有一千多海軍成員，還有一個海軍陸戰隊的連隊，也是一年前開始組建，現在才成型。陸戰人員數量是少了點，不過裝備都是清一色的81式槍族，加上艦炮的支援，打任何海盜都不會有問題。這裡可沒有電影裡面那種神魔花的海盜船，也沒有受到詛咒而且不死的海盜團。伊吉克首先和西班牙人通了氣，敏感的他在西班牙人的述說當中發現了不對勁。
在請求了國安部的間諜和特工幫助後，他鎖定了一個目標。之前和科爾森合作的巨鯊海盜團，因爲在出售公司出產的物資而被他發現。巨鯊海盜團曾經輝煌過，不過最近是他們的低谷期。原本幾十艘海盜船，現在就剩下五艘，團員也就只有不到四百。剛跟着科爾森搶劫了一把，自然是要把贓物賣出去，獲得資金好復甦海盜團。
公司的商品從來不缺乏需要的人，這讓他們的贓物處理過程異常順利，同時也引起了一點轟動。伊吉克就這麼發現了他們的販賣船和人員，一支在跟蹤他們，等到他們返程的時候，就是巨鯊海盜團滅亡的時候。